RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614333.1

ACACA-230, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 3

Gene ACACA, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-230	ENST00000614333	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	ZNF609	O15014	1411 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	C21orf2	O43822	256 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACACA-230	ENST00000614333	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	COL4A1	P02462	1669 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	UFL1	O94874	794 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	IL1R1	P14778	569 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	HAUS7	Q99871	368 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	ADORA1	P30542	326 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	RGS3	P49796	1198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	MMP14	P50281	582 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	BCAM	P50895	628 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	SNAP23	O00161	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	PHKA1	P46020	1223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	GYG1	P46976	350 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333		G3V3G9	751 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	HIP1	O00291	1037 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	SDS	P20132	328 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	MCAM	P43121	646 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACACA-230	ENST00000614333	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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