RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 SDF4Q9BRK5 362 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 CPA1P15085 419 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 ME1P48163 572 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 GPS2Q13227 327 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP2B3Q16720 1220 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 FSIP1Q8NA03 581 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 NBPF4Q96M43 638 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF609O15014 1411 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 POTEB2H3BUK9 544 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP6R2O75170 966 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP21A2P08686 494 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CMA1P23946 247 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 NLRP12P59046 1061 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCZ1BP86790 482 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SCRN1Q12765 414 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 STK38Q15208 465 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF790Q6PG37 636 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 KAZALD1Q96I82 304 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 LGR6Q9HBX8 967 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAI1Q9UI46 699 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 C5P01031 1676 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC20A2Q08357 652 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 LRMPQ12912 555 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TERF2Q15554 542 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 KANK3Q6NY19 840 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 WASF1Q92558 559 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf76Q96K31 380 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MTA3Q9BTC8 594 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PAG1Q9NWQ8 432 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SPTLC2O15270 562 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP6O43182 974 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV5-2P06315 115 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNA6P17658 529 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 RCAN1P53805 252 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MYL5Q02045 173 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PDIA6Q15084 440 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 OLFM4Q6UX06 510 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MNS1Q8NEH6 495 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 UBXN4Q92575 508 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 DCAF5Q96JK2 942 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms