RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 BCL11AQ9H165 835 aa16.64■□□□□ 0.25
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CCNDBP1-209ENST00000566833 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 SASH1O94885 1247 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 VPS37DQ86XT2 251 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.63■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.63■□□□□ 0.25
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CCNDBP1-209ENST00000566833 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A1B0GUL7 405 aa16.61■□□□□ 0.25
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CCNDBP1-209ENST00000566833 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa16.61■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 GPR108Q9NPR9 543 aa16.61■□□□□ 0.25
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CCNDBP1-209ENST00000566833 GYG1P46976 350 aa16.6■□□□□ 0.25
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.6■□□□□ 0.25
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CCNDBP1-209ENST00000566833 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa16.6■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF609O15014 1411 aa16.6■□□□□ 0.25
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CCNDBP1-209ENST00000566833 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CCNDBP1-209ENST00000566833 PODNQ7Z5L7 613 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 FBXW7Q969H0 707 aa16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 XAGE2Q96GT9 111 aa16.58■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-209ENST00000566833 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.57■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TNIP1Q15025 636 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.56■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-209ENST00000566833 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.56■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC102BQ68D86 513 aa16.55■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 DBNDD2Q9BQY9 259 aa16.55■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-209ENST00000566833 IL1R1P14778 569 aa16.54■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-209ENST00000566833 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.54■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.53■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.53■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 GTF2IP78347 998 aa16.53■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 CXCL9Q07325 125 aa16.53■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 GPATCH3Q96I76 525 aa16.53■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-209ENST00000566833 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.53■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 SEMA3EO15041 775 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 TTLL5Q6EMB2 1281 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 JAG2Q9Y219 1238 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-209ENST00000566833 GLTPD2A6NH11 291 aa16.51■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-209ENST00000566833 YY1P25490 414 aa16.51■□□□□ 0.23
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