RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559613.1

PSME2-211, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 3

Gene PSME2, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-211	ENST00000559613	ATP9B	O43861	1147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	ABCC1	P33527	1531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	USP21	Q9UK80	565 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	MSH6	P52701	1360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PSME2-211	ENST00000559613	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	KCNQ2	O43526	872 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	CCIN	Q13939	588 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	RTN1	Q16799	776 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	RAD21	O60216	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	MAP3K6	O95382	1288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	GRIK5	Q16478	980 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	PCSK7	Q16549	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	BCS1L	Q9Y276	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	ABCC3	O15438	1527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	ATP7A	Q04656	1500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	ATRN	O75882	1429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	NFKB1	P19838	968 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	TTC9	Q92623	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	EPB42	P16452	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	INPP5B	P32019	993 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	SEC13	P55735	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	FAM35A	Q86V20	835 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	TNR	Q92752	1358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	PLCH2	O75038	1416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	IGFBP4	P22692	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	NOS3	P29474	1203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	GPLD1	P80108	840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	FLII	Q13045	1269 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSME2-211	ENST00000559613	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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