RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	CA12	O43570	354 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	ITGA6	P23229	1130 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	RGMB	Q6NW40	437 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	ABHD8	Q96I13	439 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	SPEF2	Q9C093	1822 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
PPP4R4-204	ENST00000555690	PSME4	Q14997	1843 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	CDCA5	Q96FF9	252 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	CSF1R	P07333	972 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	MXD3	Q9BW11	206 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	FBXW7	Q969H0	707 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	DACT2	Q5SW24	774 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	COA1	Q9GZY4	146 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC102A	Q96A19	550 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690		F6X3S4	739 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	KLRK1	P26718	216 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP4R4-204	ENST00000555690	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.14	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHRND	Q07001	517 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	OGFOD1	Q8N543	542 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCNJ4	P48050	445 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	FOXO4	P98177	505 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	BEND3	Q5T5X7	828 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC10A3	P09131	477 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PPP4R4-204	ENST00000555690	SNAP23	O00161	211 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	WNT10B	O00744	389 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	TAF5L	O75529	589 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	FKBP1B	P68106	108 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	GTF2I	P78347	998 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	MOB2	Q70IA6	237 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	SASH1	O94885	1247 aa		31.04	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		31.04	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	CSRNP1	Q96S65	589 aa		31.04	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRPA1	O75762	1119 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	CD209	Q9NNX6	404 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	RNF186	Q9NXI6	227 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PPP4R4-204	ENST00000555690	GRM8	O00222	908 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	MMP14	P50281	582 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	DGKZ	Q13574	1117 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		31	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		31	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	30.98	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		30.97	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	CERS5	Q8N5B7	392 aa		30.97	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	30.97	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	ALDH1L1	O75891	902 aa		30.96	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		30.96	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLIN1	O60240	522 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	NF2	P35240	595 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	30.95	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PPP4R4-204	ENST00000555690	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		30.94	■■■□□ 2.54
PPP4R4-204	ENST00000555690	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54
PPP4R4-204	ENST00000555690	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		30.94	■■■□□ 2.54
PPP4R4-204	ENST00000555690	IL1R1	P14778	569 aa		30.93	■■■□□ 2.54
PPP4R4-204	ENST00000555690	DLGAP5	Q15398	846 aa		30.92	■■■□□ 2.54
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF521	Q96K83	1311 aa		30.92	■■■□□ 2.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms