RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.83■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR63Q8IWG1 891 aa28.83■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.83■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC102AQ96A19 550 aa28.83■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.83■■■□□ 2.21
TRDMT1-211ENST00000495022 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 CDCA5Q96FF9 252 aa28.82■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 ZIC5Q96T25 663 aa28.82■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.82■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.81■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 CASP7P55210 303 aa28.81■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 LINS1Q8NG48 757 aa28.81■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1B0GUL6 1792 aa28.81■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 ITGA6P23229 1130 aa28.8■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 COA1Q9GZY4 146 aa28.8■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO3BQ8WXR4 1341 aa28.79■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 ANP32CO43423 234 aa28.79■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 VAMP4O75379 141 aa28.79■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 CSF1RP07333 972 aa28.79■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM161AQ3B820 660 aa28.78■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 DACT2Q5SW24 774 aa28.78■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.78■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD2Q9GZV1 360 aa28.78■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.77■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 MMP14P50281 582 aa28.76■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 FKBP1BP68106 108 aa28.76■■■□□ 2.2
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.76■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC10A3P09131 477 aa28.75■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 OGFOD1Q8N543 542 aa28.75■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 SAGE1Q9NXZ1 904 aa28.75■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.75■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.72■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.72■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXW7Q969H0 707 aa28.72■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 MXD3Q9BW11 206 aa28.72■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.71■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 CHRNDQ07001 517 aa28.71■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 MCOLN1Q9GZU1 580 aa28.71■■■□□ 2.19
TRDMT1-211ENST00000495022 WNT10BO00744 389 aa28.7■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 KLRK1P26718 216 aa28.7■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNJ4P48050 445 aa28.7■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.7■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.69■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 BEND3Q5T5X7 828 aa28.69■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.69■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 FOXO4P98177 505 aa28.68■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 F6X3S4 739 aa28.67■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CSRNP1Q96S65 589 aa28.67■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF186Q9NXI6 227 aa28.67■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 DGKZQ13574 1117 aa28.66■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.66■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 GTF2IP78347 998 aa28.65■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CD209Q9NNX6 404 aa28.65■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.65■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPA1O75762 1119 aa28.64■■■□□ 2.18
TRDMT1-211ENST00000495022 NF2P35240 595 aa28.63■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.63■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.63■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 GRM8O00222 908 aa28.62■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 SASH1O94885 1247 aa28.62■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 RGS19P49795 217 aa28.62■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.62■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 MOB2Q70IA6 237 aa28.62■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF5LO75529 589 aa28.62■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.61■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.61■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 SNAP23O00161 211 aa28.6■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.6■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.6■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 ALDH1L1O75891 902 aa28.59■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.59■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.59■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 IL1R1P14778 569 aa28.58■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.58■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
TRDMT1-211ENST00000495022 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.57■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.57■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 CERS5Q8N5B7 392 aa28.57■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms