RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491426.3

PDE4DIP-216, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4DIP, Length 670 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-216ENST00000491426 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.08■□□□□ 0.17
PDE4DIP-216ENST00000491426 KCNA3P22001 575 aa16.08■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 ADORA1P30542 326 aa16.08■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 VPS37DQ86XT2 251 aa16.08■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 CNTROBQ8N137 903 aa16.08■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.08■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.07■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 UFL1O94874 794 aa16.07■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 TSHZ3Q63HK5 1081 aa16.07■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 CCDC102BQ68D86 513 aa16.07■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 EYA3Q99504 573 aa16.07■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 CACNA1SQ13698 1873 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 SLX4Q8IY92 1834 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 C6orf229H3BNL8 230 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 CCDC93Q567U6 631 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 RTKN2Q8IZC4 609 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 SUPT20HQ8NEM7 779 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 HAUS7Q99871 368 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.06■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 SNAP23O00161 211 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 SEMA3EO15041 775 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZBTB22O15209 634 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 SDSP20132 328 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 CASC1Q6TDU7 716 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 TICAM2Q86XR7 235 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 RILPL2Q969X0 211 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 EVI5LQ96CN4 794 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 MED23Q9ULK4 1368 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 C21orf2O43822 256 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 PHKA1P46020 1223 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 BCAMP50895 628 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 POLLQ9UGP5 575 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 GYG1P46976 350 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 HIP1O00291 1037 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 CDC45O75419 566 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 WASHC4Q2M389 1173 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 VPS33BQ9H267 617 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 LTBP1Q14766 1721 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 G3V3G9 751 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 MCAMP43121 646 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 SPATA5Q8NB90 893 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 PSMD1Q99460 953 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 COA1Q9GZY4 146 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 OLFM4Q6UX06 510 aa16■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 HMG20BQ9P0W2 317 aa16■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 BCS1LQ9Y276 419 aa16■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 GOLIM4O00461 696 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 IGSF3O75054 1194 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 KLRK1P26718 216 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZAP70P43403 619 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 RASGRF1Q13972 1273 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 SCARF1Q14162 830 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 FSD1Q9BTV5 496 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 AK9Q5TCS8 1911 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.99■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 RIMBP2O15034 1052 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 IL1R1P14778 569 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 SLC51AQ86UW1 340 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 SYT17Q9BSW7 474 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 CD209Q9NNX6 404 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 SNRKQ9NRH2 765 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms