RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.4■■□□□ 1.18
C7orf49-210ENST00000486115 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.4■■□□□ 1.18
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C7orf49-210ENST00000486115 GPR108Q9NPR9 543 aa22.4■■□□□ 1.18
C7orf49-210ENST00000486115 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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C7orf49-210ENST00000486115 DCTPP1Q9H773 170 aa22.39■■□□□ 1.17
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C7orf49-210ENST00000486115 ECE2O60344 883 aa22.38■■□□□ 1.17
C7orf49-210ENST00000486115 KLRK1P26718 216 aa22.38■■□□□ 1.17
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C7orf49-210ENST00000486115 VPS37DQ86XT2 251 aa22.38■■□□□ 1.17
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C7orf49-210ENST00000486115 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.38■■□□□ 1.17
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C7orf49-210ENST00000486115 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.36■■□□□ 1.17
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C7orf49-210ENST00000486115 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.35■■□□□ 1.17
C7orf49-210ENST00000486115 GYG1P46976 350 aa22.34■■□□□ 1.17
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C7orf49-210ENST00000486115 GORABQ5T7V8 394 aa22.34■■□□□ 1.17
C7orf49-210ENST00000486115 CD209Q9NNX6 404 aa22.34■■□□□ 1.17
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C7orf49-210ENST00000486115 UTRNP46939 3433 aa22.34■■□□□ 1.17
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.33■■□□□ 1.17
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C7orf49-210ENST00000486115 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.33■■□□□ 1.17
C7orf49-210ENST00000486115 XAGE2Q96GT9 111 aa22.33■■□□□ 1.17
C7orf49-210ENST00000486115 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.32■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 YDJCA8MPS7 323 aa22.32■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 IL1R1P14778 569 aa22.32■■□□□ 1.16
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C7orf49-210ENST00000486115 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.32■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.31■■□□□ 1.16
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C7orf49-210ENST00000486115 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.31■■□□□ 1.16
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C7orf49-210ENST00000486115 USP17L4A6NCW7 530 aa22.3■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 GLTPD2A6NH11 291 aa22.3■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 RAD17O75943 681 aa22.3■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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C7orf49-210ENST00000486115 CXCL9Q07325 125 aa22.3■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.3■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 GPC2Q8N158 579 aa22.3■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.29■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC102BQ68D86 513 aa22.29■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 FBXW7Q969H0 707 aa22.29■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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C7orf49-210ENST00000486115 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.28■■□□□ 1.16
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C7orf49-210ENST00000486115 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.28■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 PSMD14O00487 310 aa22.27■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 ZBTB22O15209 634 aa22.27■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 IGHDP01880 384 aa22.27■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.27■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 PHKA1P46020 1223 aa22.27■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.27■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 SMC5Q8IY18 1101 aa22.27■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.27■■□□□ 1.16
C7orf49-210ENST00000486115 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 GTF2IP78347 998 aa22.26■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.26■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.26■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 BCL11AQ9H165 835 aa22.26■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.26■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.26■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.25■■□□□ 1.15
C7orf49-210ENST00000486115 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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