RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481600.5

EDRF1-208, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene EDRF1, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDRF1-208	ENST00000481600	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	TAF5L	O75529	589 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	LIG1	P18858	919 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNF165	P49910	485 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	TFCP2	Q12800	502 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	PDIA6	Q15084	440 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	BIN1	O00499	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600		Q6ZUG5	572 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.52	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	GOLIM4	O00461	696 aa		13.52	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.52	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		13.52	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.52	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	BRF1	Q92994	677 aa		13.52	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.52	□□□□□ -0.24
EDRF1-208	ENST00000481600	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	TNNT1	P13805	278 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	STIM1	Q13586	685 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	HAND2	P61296	217 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	JAK2	O60674	1132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	STARD3NL	O95772	234 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	LUZP1	Q86V48	1076 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	ERBB3	P21860	1342 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	NAPB	Q9H115	298 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNF213	O14771	459 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	PHKG2	P15735	406 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	CDR1	P51861	262 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600		H0YHG0	523 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EDRF1-208	ENST00000481600	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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