RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GMLQ99445 158 aa33.34■■■□□ 2.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPHOSPH8Q99549 860 aa33.34■■■□□ 2.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGA3Q9NZ52 723 aa33.34■■■□□ 2.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LEMD3Q9Y2U8 911 aa33.34■■■□□ 2.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F6X3S4 739 aa33.33■■■□□ 2.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD2Q9GZV1 360 aa33.33■■■□□ 2.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L8P0C7I0 530 aa33.32■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HUNKP57058 714 aa33.32■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SULF1Q8IWU6 871 aa33.32■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BEND3Q5T5X7 828 aa33.31■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COA1Q9GZY4 146 aa33.3■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYOZ2Q9NPC6 264 aa33.3■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF804BA4D1E1 1349 aa33.29■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa33.29■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCARF1Q14162 830 aa33.29■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf69Q8N8R5 385 aa33.29■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DACT2Q5SW24 774 aa33.27■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXNRD3Q86VQ6 643 aa33.27■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXW7Q969H0 707 aa33.27■■■□□ 2.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXO4P98177 505 aa33.26■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ4P48050 445 aa33.25■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNDQ07001 517 aa33.25■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOGQ13253 232 aa33.25■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STRIP1Q5VSL9 837 aa33.25■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHMP3Q9Y3E7 222 aa33.25■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDCA5Q96FF9 252 aa33.24■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MXD3Q9BW11 206 aa33.24■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO3BQ8WXR4 1341 aa33.24■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CA12O43570 354 aa33.23■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLRK1P26718 216 aa33.23■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGMBQ6NW40 437 aa33.23■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OGFOD1Q8N543 542 aa33.23■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRM8O00222 908 aa33.22■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF521Q96K83 1311 aa33.22■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa33.22■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSKSQ9UJT2 592 aa33.21■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC4A10Q6U841 1118 aa33.2■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMBR1LQ6UX01 489 aa33.2■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH1L1O75891 902 aa33.19■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLL5Q6EMB2 1281 aa33.19■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC102AQ96A19 550 aa33.19■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPHA10Q5JZY3 1008 aa33.18■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZIC5Q96T25 663 aa33.18■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa33.18■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF5LO75529 589 aa33.17■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC57Q2TAC2 916 aa33.17■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF9Q3BBW0 867 aa33.17■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP14P50281 582 aa33.16■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2IP78347 998 aa33.16■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNAP23O00161 211 aa33.15■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF7LQ5H9L4 462 aa33.15■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD209Q9NNX6 404 aa33.15■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRS2Q9Y4H2 1338 aa33.13■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT10BO00744 389 aa33.13■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKBP1BP68106 108 aa33.13■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa33.13■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0825Q8IV33 1275 aa33.13■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDAC9Q9UKV0 1011 aa33.13■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GUL6 1792 aa33.13■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNNM1Q9NRU3 951 aa33.12■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E9PSI1 815 aa33.1■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SASH1O94885 1247 aa33.1■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC10A3P09131 477 aa33.1■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF804AQ7Z570 1209 aa33.1■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa33.1■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLIN1O60240 522 aa33.09■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD8Q96I13 439 aa33.09■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa33.08■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUCLG2Q96I99 432 aa33.08■■■□□ 2.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL1R1P14778 569 aa33.06■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASAL3Q86YV0 1011 aa33.05■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KAZALD1Q96I82 304 aa33.05■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTYO14607 1347 aa33.04■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRCP08575 1304 aa33.04■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NF2P35240 595 aa33.04■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOB2Q70IA6 237 aa33.04■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CERS5Q8N5B7 392 aa33.04■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAGE1Q9NXZ1 904 aa33.03■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa33.02■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2Q2LH0YL09 131 aa33.02■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLFN5Q08AF3 891 aa33.02■■■□□ 2.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms