RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 PASKQ96RG2 1323 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 G3V3G9 751 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 KCNJ4P48050 445 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 SAMD7Q7Z3H4 446 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 PODNQ7Z5L7 613 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 GMLQ99445 158 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 COA1Q9GZY4 146 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 APLP1P51693 650 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 DACT2Q5SW24 774 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 VGLL2Q8N8G2 317 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 DPF2Q92785 391 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 CD209Q9NNX6 404 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L3A6NCW0 530 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L4A6NCW7 530 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L1Q7RTZ2 530 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 ATG9AQ7Z3C6 839 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 CNTROBQ8N137 903 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
ATG4B-210ENST00000428861 RPS12P25398 132 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 DLK2Q6UY11 383 aa13.45□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 PSME4Q14997 1843 aa13.45□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF609O15014 1411 aa13.45□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 MROH5Q6ZUA9 1318 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 H7C1D1 291 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 EYA2O00167 538 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 TRAF5O00463 557 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 GNAI3P08754 354 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 IL1R1P14778 569 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 GYG1P46976 350 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 GTF2IP78347 998 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 UBE4AQ14139 1066 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 METTL24Q5JXM2 366 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 AGBL3Q8NEM8 1001 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 PANK1Q8TE04 598 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 FBXW7Q969H0 707 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 SIL1Q9H173 461 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 PGAP2Q9UHJ9 254 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 JAG2Q9Y219 1238 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 PDE8BO95263 885 aa13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 FGFR2P21802 821 aa13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 CERS5Q8N5B7 392 aa13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa13.42□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 GNAI2P04899 355 aa13.42□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 MTX1Q13505 466 aa13.42□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 COPRSQ9NQ92 184 aa13.42□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 SRGAP3O43295 1099 aa13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L8P0C7I0 530 aa13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF804AQ7Z570 1209 aa13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 FBXO33Q7Z6M2 555 aa13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 ITPRIPQ8IWB1 547 aa13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.41□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 CIAO1O76071 339 aa13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 BCAMP50895 628 aa13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 CST9Q5W186 159 aa13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 MYOZ2Q9NPC6 264 aa13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 CREBZFQ9NS37 354 aa13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa13.4□□□□□ -0.26
ATG4B-210ENST00000428861 SASH1O94885 1247 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 SCARF1Q14162 830 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 GRIK5Q16478 980 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 NBPF9Q3BBW0 867 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 USP48Q86UV5 1035 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 KLRG1Q96E93 195 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 HDAC5Q9UQL6 1122 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 FAM205AQ6ZU69 1335 aa13.39□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 PCNTO95613 3336 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms