RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 IMPACTQ9P2X3 320 aa19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 H7C1W4 665 aa19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 JAK2O60674 1132 aa19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 FGD1P98174 961 aa19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 CEP57L1Q8IYX8 460 aa19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 CTNNA3Q9UI47 895 aa19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 PAPPAQ13219 1627 aa19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 STK3Q13188 491 aa19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 FAM173BQ6P4H8 233 aa19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 ENGASEQ8NFI3 743 aa19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJC25Q9H1X3 360 aa19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 PAG1Q9NWQ8 432 aa19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 TAF6LQ9Y6J9 622 aa19.73■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 MEGF6O75095 1541 aa19.72■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.72■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 TCEANC2Q96MN5 208 aa19.72■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 DBNDD2Q9BQY9 259 aa19.72■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 RTEL1Q9NZ71 1219 aa19.72■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 AXIN2Q9Y2T1 843 aa19.72■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 A0A087WZG4 1122 aa19.71■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 YEATS4O95619 227 aa19.71■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa19.71■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 MYL6BP14649 208 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 DMTNQ08495 405 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 BRAPQ7Z569 592 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC112Q8NEF3 446 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 BECN2A8MW95 431 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 TNNT1P13805 278 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 ADALQ6DHV7 355 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC8AQ8IWT6 810 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 MPNDQ8N594 471 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.7■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CPDO75976 1380 aa19.69■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 MYO1BO43795 1136 aa19.69■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 STOX1Q6ZVD7 989 aa19.69■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.69■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.68■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 NRDCO43847 1150 aa19.68■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 FOXO4P98177 505 aa19.68■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 TPRNQ4KMQ1 711 aa19.68■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.68■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.68■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 ORAI2Q96SN7 254 aa19.68■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 POLR3EQ9NVU0 708 aa19.68■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 E7EWF7 191 aa19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 EYA2O00167 538 aa19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CTDNEP1O95476 244 aa19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 TPM4P67936 248 aa19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 SLC39A6Q13433 755 aa19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 ATG9AQ7Z3C6 839 aa19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC150Q8NCX0 1101 aa19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 SLAIN2Q9P270 581 aa19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 PRDM4Q9UKN5 801 aa19.67■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 FAM193AP78312 1265 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 SLFNL1Q499Z3 407 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 LMBR1LQ6UX01 489 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 NYAP1Q6ZVC0 841 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 OGFRQ9NZT2 677 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 NHSL1Q5SYE7 1610 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CCP110O43303 1012 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 FSIP1Q8NA03 581 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 DDX11Q96FC9 970 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 USP28Q96RU2 1077 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 AKAP2Q9Y2D5 859 aa19.66■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 MYH7P12883 1935 aa19.65■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 KIF20AO95235 890 aa19.65■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 CEP135Q66GS9 1140 aa19.65■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 TIGD1Q96MW7 591 aa19.65■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 USP16Q9Y5T5 823 aa19.65■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 MAST3O60307 1309 aa19.65■□□□□ 0.74
HCLS1-202ENST00000428394 ME1P48163 572 aa19.64■□□□□ 0.73
HCLS1-202ENST00000428394 LRMPQ12912 555 aa19.64■□□□□ 0.73
HCLS1-202ENST00000428394 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms