RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418189.5

HDAC11-209, Transcript of histone deacetylase 11, human

TSL 5

Gene HDAC11, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC11-209	ENST00000418189	NOG	Q13253	232 aa		31.45	■■■□□ 2.63
HDAC11-209	ENST00000418189	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		31.45	■■■□□ 2.63
HDAC11-209	ENST00000418189	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
HDAC11-209	ENST00000418189	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	USP17L8	P0C7I0	530 aa		31.43	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	ITGA6	P23229	1130 aa		31.43	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		31.43	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	CSF1R	P07333	972 aa		31.42	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.42	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	RGMB	Q6NW40	437 aa		31.42	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	SCARF1	Q14162	830 aa		31.41	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		31.41	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	TSKS	Q9UJT2	592 aa		31.41	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		31.4	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	COA1	Q9GZY4	146 aa		31.4	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	CDCA5	Q96FF9	252 aa		31.39	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		31.39	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		31.39	■■■□□ 2.62
HDAC11-209	ENST00000418189	DACT2	Q5SW24	774 aa		31.38	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	ABHD8	Q96I13	439 aa		31.38	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	ZIC5	Q96T25	663 aa		31.38	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	CCDC102A	Q96A19	550 aa		31.37	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		31.37	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		31.37	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189		A0A1B0GUL6	1792 aa		31.36	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		31.36	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		31.36	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		31.35	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		31.35	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	BEND3	Q5T5X7	828 aa		31.34	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		31.33	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189		F6X3S4	739 aa		31.33	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	FBXW7	Q969H0	707 aa		31.33	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	MXD3	Q9BW11	206 aa		31.33	■■■□□ 2.61
HDAC11-209	ENST00000418189	KLRK1	P26718	216 aa		31.32	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	MMP14	P50281	582 aa		31.32	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	CHRND	Q07001	517 aa		31.32	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	OGFOD1	Q8N543	542 aa		31.32	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	SLC10A3	P09131	477 aa		31.31	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	FKBP1B	P68106	108 aa		31.31	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	FOXO4	P98177	505 aa		31.31	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		31.3	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	KCNJ4	P48050	445 aa		31.3	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		31.3	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		31.29	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		31.28	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		31.28	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	WNT10B	O00744	389 aa		31.27	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		31.26	■■■□□ 2.6
HDAC11-209	ENST00000418189	GRM8	O00222	908 aa		31.26	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		31.26	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	GTF2I	P78347	998 aa		31.25	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	CD209	Q9NNX6	404 aa		31.25	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		31.24	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		31.24	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		31.24	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	TAF5L	O75529	589 aa		31.23	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	ALDH1L1	O75891	902 aa		31.23	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		31.23	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	SNAP23	O00161	211 aa		31.22	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	SASH1	O94885	1247 aa		31.22	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		31.22	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		31.22	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.22	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		31.21	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		31.2	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	CSRNP1	Q96S65	589 aa		31.2	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	RNF186	Q9NXI6	227 aa		31.2	■■■□□ 2.59
HDAC11-209	ENST00000418189	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		31.19	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	MOB2	Q70IA6	237 aa		31.19	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		31.19	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	NF2	P35240	595 aa		31.18	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		31.18	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		31.18	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		31.18	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	TRPA1	O75762	1119 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	IL1R1	P14778	569 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		31.16	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	DGKZ	Q13574	1117 aa		31.16	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	CERS5	Q8N5B7	392 aa		31.16	■■■□□ 2.58
HDAC11-209	ENST00000418189	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58

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