RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 GRAPQ13588 217 aa21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.99■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 PDE8BO95263 885 aa21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 TMC4Q7Z404 712 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1B0GUL7 405 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 CDC45O75419 566 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 ATP2B3Q16720 1220 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 C8orf34Q49A92 452 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 GORABQ5T7V8 394 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 CNTROBQ8N137 903 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF609O15014 1411 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 LTBP1Q14766 1721 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 ATP5JP18859 108 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 TICAM2Q86XR7 235 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 LPIN2Q92539 896 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 BBOX1O75936 387 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 SLC5A1P13866 664 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 FSTL1Q12841 308 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 WDR90Q96KV7 1748 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 POTECB2RU33 542 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 SDSP20132 328 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 APLP1P51693 650 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 SLC51AQ86UW1 340 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 SNED1Q8TER0 1413 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 PSMD1Q99460 953 aa21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 TIMM10P62072 90 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 CHRNDQ07001 517 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 EVI5LQ96CN4 794 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 HIP1O00291 1037 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 UBE4AQ14139 1066 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 RILPL2Q969X0 211 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 XAGE2Q96GT9 111 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.89■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 FGFR2P21802 821 aa21.89■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.89■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.89■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.89■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 HAUS7Q99871 368 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 KCNJ4P48050 445 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 JDP2Q8WYK2 163 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 FZD9O00144 591 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 SP8Q8IXZ3 490 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 HTRA3P83110 453 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 COL4A5P29400 1685 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 TAF5LO75529 589 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 XDHP47989 1333 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE4-201ENST00000324444 REC8O95072 547 aa21.83■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB22O15209 634 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 POTEIP0CG38 1075 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 POTEJP0CG39 1038 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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