RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 M0R2C6 588 aa27.25■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 SLC5A1P13866 664 aa27.25■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 NUCB2P80303 420 aa27.25■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.25■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 OSBP2Q969R2 916 aa27.25■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 PSMA5P28066 241 aa27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 RFC4P35249 363 aa27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNDQ07001 517 aa27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 TSGA10IPQ3SY00 556 aa27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 NYXQ9GZU5 481 aa27.24■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.23■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.22■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM37O94972 964 aa27.22■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 CYP21A2P08686 494 aa27.22■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 WASHC4Q2M389 1173 aa27.22■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 GBP4Q96PP9 640 aa27.22■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.21■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.21■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 DSCC1Q9BVC3 393 aa27.21■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.21■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.21■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.21■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.2■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 LARGE1O95461 756 aa27.2■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 C4AP0C0L4 1744 aa27.2■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.19■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 TCEANC2Q96MN5 208 aa27.19■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC9Q9Y397 364 aa27.19■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 RPS6KB1P23443 525 aa27.18■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 APPBP2Q92624 585 aa27.18■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP3Q96P20 1036 aa27.18■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.18■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 KRT32Q14532 448 aa27.18■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 CASZ1Q86V15 1759 aa27.17■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 RASGRF1Q13972 1273 aa27.17■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 TAF1P21675 1872 aa27.17■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 BCAMP50895 628 aa27.16■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA5Q8NB90 893 aa27.16■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JLW4 131 aa27.16■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 ADD2P35612 726 aa27.16■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.16■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC17AQ6ZS10 378 aa27.16■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 NEK1Q96PY6 1258 aa27.16■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 GSE1Q14687 1217 aa27.15■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 FOXP2O15409 715 aa27.15■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 NFIXQ14938 502 aa27.15■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.15■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.15■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.14■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.14■■□□□ 1.94
VSTM4-201ENST00000298454 ADRA2BP18089 450 aa27.14■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 ME3Q16798 604 aa27.14■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.14■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 NPHP1O15259 732 aa27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 TTLL5Q6EMB2 1281 aa27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 GPAA1O43292 621 aa27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 TRAK2O60296 914 aa27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.11■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 ST3GAL1Q11201 340 aa27.11■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 MYH7P12883 1935 aa27.11■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 BRD1O95696 1058 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 PDE6AP16499 860 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD1Q15327 319 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 UBE3CQ15386 1083 aa27.1■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
VSTM4-201ENST00000298454 NECAB1Q8N987 351 aa27.1■■□□□ 1.93
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