RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.71■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.71■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 SCARF1Q14162 830 aa25.7■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 ERFEQ4G0M1 354 aa25.7■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.7■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.7■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.7■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1B0GUL6 1792 aa25.7■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 BRD1O95696 1058 aa25.69■■□□□ 1.7
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
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SNRNP25-201ENST00000293861 SETDB2Q96T68 719 aa25.69■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 MAST3O60307 1309 aa25.69■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 ZAP70P43403 619 aa25.68■■□□□ 1.7
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SNRNP25-201ENST00000293861 C4AP0C0L4 1744 aa25.67■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.67■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC5A1P13866 664 aa25.67■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 MCAMP43121 646 aa25.67■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.67■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.67■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 DOCK2Q92608 1830 aa25.67■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.67■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP21A2P08686 494 aa25.66■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.66■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 SMIM5Q71RC9 77 aa25.66■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 ADRA2BP18089 450 aa25.65■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.65■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.65■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC102BQ68D86 513 aa25.65■■□□□ 1.7
SNRNP25-201ENST00000293861 LARGE1O95461 756 aa25.64■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 APPBP2Q92624 585 aa25.64■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 OSBP2Q969R2 916 aa25.64■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 NEK1Q96PY6 1258 aa25.64■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.63■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.63■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 M0R2C6 588 aa25.63■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 RFC4P35249 363 aa25.63■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.63■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.63■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.63■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 PHKA1P46020 1223 aa25.62■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 ME3Q16798 604 aa25.62■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 PI16Q6UXB8 463 aa25.62■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.62■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
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SNRNP25-201ENST00000293861 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.61■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 CHRNDQ07001 517 aa25.61■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 MCTP1Q6DN14 999 aa25.61■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.61■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.61■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 TAF1P21675 1872 aa25.6■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 COL4A1P02462 1669 aa25.6■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 ADD2P35612 726 aa25.59■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRP3Q96P20 1036 aa25.59■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.59■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 ST3GAL1Q11201 340 aa25.59■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 WASHC4Q2M389 1173 aa25.59■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.59■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.59■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.58■■□□□ 1.69
SNRNP25-201ENST00000293861 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.57■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 PHF14O94880 888 aa25.57■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 UBE3CQ15386 1083 aa25.57■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.57■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.57■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXP2O15409 715 aa25.56■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 TCHHQ07283 1943 aa25.56■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM37O94972 964 aa25.55■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA5Q8NB90 893 aa25.55■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.55■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 UBE4AQ14139 1066 aa25.55■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 SYT1P21579 422 aa25.54■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 GJB2P29033 226 aa25.54■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.54■■□□□ 1.68
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