RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PI16Q6UXB8 463 aa29.06■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa29.05■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BCAMP50895 628 aa29.05■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBE4AQ14139 1066 aa29.05■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.05■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNA3P22001 575 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GYG1P46976 350 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNJ4P48050 445 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNRKQ9NRH2 765 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WWC3Q9ULE0 1092 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AK9Q5TCS8 1911 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KLHL34Q8N239 644 aa29.04■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XDHP47989 1333 aa29.03■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SP8Q8IXZ3 490 aa29.03■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.02■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HAUS7Q99871 368 aa29.02■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LTBP1Q14766 1721 aa29.02■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MCAMP43121 646 aa29.01■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D32Q96NH3 1257 aa29.01■■■□□ 2.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.01■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IRS2Q9Y4H2 1338 aa29.01■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDC45O75419 566 aa29.01■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POLLQ9UGP5 575 aa29■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UFL1O94874 794 aa28.99■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNTROBQ8N137 903 aa28.99■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNKSR1Q969H4 720 aa28.99■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.99■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMC4Q7Z404 712 aa28.99■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GOLIM4O00461 696 aa28.98■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZAP70P43403 619 aa28.98■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.98■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.98■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.97■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.97■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GGA1Q9UJY5 639 aa28.97■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHGBP05060 677 aa28.97■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RASGRF1Q13972 1273 aa28.97■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.96■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EVI5LQ96CN4 794 aa28.96■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP2B4P23634 1241 aa28.95■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPON1Q9HCB6 807 aa28.95■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.95■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.95■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.95■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C6orf229H3BNL8 230 aa28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TGFB2P61812 414 aa28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C21orf2O43822 256 aa28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHMLP26374 656 aa28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MPNDQ8N594 471 aa28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTLL6Q8N841 843 aa28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.94■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FSD1Q9BTV5 496 aa28.93■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VPS37DQ86XT2 251 aa28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IL25Q9H293 177 aa28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA5Q8NB90 893 aa28.91■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.91■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RIMBP2O15034 1052 aa28.9■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNED1Q8TER0 1413 aa28.9■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CASC1Q6TDU7 716 aa28.88■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.88■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIM2Q9P1W9 311 aa28.88■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 JAG2Q9Y219 1238 aa28.88■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.87■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM227BQ96M60 508 aa28.87■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MED23Q9ULK4 1368 aa28.86■■■□□ 2.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms