RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 MEGF6O75095 1541 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 E7EWF7 191 aa20.29■□□□□ 0.84
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PDE4A-201ENST00000293683 SARM1Q6SZW1 724 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 FSIP1Q8NA03 581 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.29■□□□□ 0.84
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PDE4A-201ENST00000293683 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 KINO60870 393 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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PDE4A-201ENST00000293683 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.28■□□□□ 0.84
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PDE4A-201ENST00000293683 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.27■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 CEP135Q66GS9 1140 aa20.27■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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PDE4A-201ENST00000293683 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1B0GVL5 298 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 CTAGE5O15320 804 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 LRRC24Q50LG9 513 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 CCZ1BP86790 482 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 M0R2C6 588 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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PDE4A-201ENST00000293683 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.25■□□□□ 0.83
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PDE4A-201ENST00000293683 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.24■□□□□ 0.83
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PDE4A-201ENST00000293683 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFA8P51970 172 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 NBPF26B4DH59 902 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 NBPF14Q5TI25 921 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 NBPF15Q8N660 670 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 CLIC4Q9Y696 253 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 NBPF11Q86T75 865 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 OSBP2Q969R2 916 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 SDF4Q9BRK5 362 aa20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 PTPN14Q15678 1187 aa20.21■□□□□ 0.83
PDE4A-201ENST00000293683 CHRNA2Q15822 529 aa20.21■□□□□ 0.83
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PDE4A-201ENST00000293683 H7C1W4 665 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4A-201ENST00000293683 BIN1O00499 593 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4A-201ENST00000293683 FOXP2O15409 715 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4A-201ENST00000293683 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PDE4A-201ENST00000293683 NEDD4P46934 1319 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4A-201ENST00000293683 SYCP1Q15431 976 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4A-201ENST00000293683 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PDE4A-201ENST00000293683 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
PDE4A-201ENST00000293683 DCAF5Q96JK2 942 aa20.2■□□□□ 0.82
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