RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 GMLQ99445 158 aa26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 ADM5C9JUS6 153 aa26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 GGA3Q9NZ52 723 aa26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 PSME4Q14997 1843 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 SCARF1Q14162 830 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 COA1Q9GZY4 146 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 CA12O43570 354 aa26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 NOGQ13253 232 aa26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 FAM161AQ3B820 660 aa26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 SPEF2Q9C093 1822 aa26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.79■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.78■■□□□ 1.88
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NEDD8-201ENST00000250495 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
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NEDD8-201ENST00000250495 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 F6X3S4 739 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 BEND3Q5T5X7 828 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 OGFOD1Q8N543 542 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC102AQ96A19 550 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD8-201ENST00000250495 KCNJ4P48050 445 aa26.76■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 MMP14P50281 582 aa26.76■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 DACT2Q5SW24 774 aa26.76■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 FBXW7Q969H0 707 aa26.76■■□□□ 1.87
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NEDD8-201ENST00000250495 CDCA5Q96FF9 252 aa26.75■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 FOXO4P98177 505 aa26.74■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 CHRNDQ07001 517 aa26.74■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.73■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 TSKSQ9UJT2 592 aa26.73■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.73■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 MXD3Q9BW11 206 aa26.72■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 ZIC5Q96T25 663 aa26.71■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
NEDD8-201ENST00000250495 GRM8O00222 908 aa26.7■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 FKBP1BP68106 108 aa26.7■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.7■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.7■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 ALDH1L1O75891 902 aa26.69■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 KLRK1P26718 216 aa26.69■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.69■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 ABHD8Q96I13 439 aa26.69■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 CD209Q9NNX6 404 aa26.69■■□□□ 1.86
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NEDD8-201ENST00000250495 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.68■■□□□ 1.86
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NEDD8-201ENST00000250495 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.66■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF521Q96K83 1311 aa26.65■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 SLC10A3P09131 477 aa26.65■■□□□ 1.86
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NEDD8-201ENST00000250495 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.65■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 SNAP23O00161 211 aa26.64■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.64■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.64■■□□□ 1.86
NEDD8-201ENST00000250495 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.63■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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NEDD8-201ENST00000250495 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.63■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 NF2P35240 595 aa26.62■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 PLIN1O60240 522 aa26.61■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 SASH1O94885 1247 aa26.61■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 IL1R1P14778 569 aa26.61■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.61■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
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NEDD8-201ENST00000250495 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.61■■□□□ 1.85
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NEDD8-201ENST00000250495 E9PSI1 815 aa26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 RNF186Q9NXI6 227 aa26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.58■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 TRPA1O75762 1119 aa26.58■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 DLGAP5Q15398 846 aa26.58■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 MOB2Q70IA6 237 aa26.58■■□□□ 1.85
NEDD8-201ENST00000250495 SUCLG2Q96I99 432 aa26.58■■□□□ 1.85
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