RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.59■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 WASHC4Q2M389 1173 aa28.59■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SMIM5Q71RC9 77 aa28.59■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.59■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD1Q15327 319 aa28.58■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.58■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC102BQ68D86 513 aa28.58■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 PI16Q6UXB8 463 aa28.58■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 FGFR2P21802 821 aa28.58■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS6KB1P23443 525 aa28.58■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 NYXQ9GZU5 481 aa28.58■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SETDB2Q96T68 719 aa28.57■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.57■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.57■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.57■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 PHKA1P46020 1223 aa28.56■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 NEK1Q96PY6 1258 aa28.56■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC9Q9Y397 364 aa28.56■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 M0R2C6 588 aa28.55■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP21A2P08686 494 aa28.55■■■□□ 2.16
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RPUSD1-201ENST00000007264 OSBP2Q969R2 916 aa28.55■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 APPBP2Q92624 585 aa28.55■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.54■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 SMC3Q9UQE7 1217 aa28.54■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 C4BP0C0L5 1744 aa28.54■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CASZ1Q86V15 1759 aa28.53■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 MCTP1Q6DN14 999 aa28.53■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 LARGE1O95461 756 aa28.52■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 BRD1O95696 1058 aa28.52■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CHRNDQ07001 517 aa28.52■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC83Q8IWF9 413 aa28.52■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.52■■■□□ 2.16
RPUSD1-201ENST00000007264 RFC4P35249 363 aa28.51■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.51■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.5■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.5■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 IDH1O75874 414 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
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RPUSD1-201ENST00000007264 ME3Q16798 604 aa28.5■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.5■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa28.5■■■□□ 2.15
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RPUSD1-201ENST00000007264 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.49■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.49■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 SPATA5Q8NB90 893 aa28.49■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.49■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 NLRP3Q96P20 1036 aa28.49■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
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RPUSD1-201ENST00000007264 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
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RPUSD1-201ENST00000007264 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.47■■■□□ 2.15
RPUSD1-201ENST00000007264 C4AP0C0L4 1744 aa28.47■■■□□ 2.15
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RPUSD1-201ENST00000007264 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.44■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 COL4A1P02462 1669 aa28.44■■■□□ 2.14
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RPUSD1-201ENST00000007264 Q6ZUG5 572 aa28.44■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.44■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 E7EWF7 191 aa28.43■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP3K12Q12852 859 aa28.43■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF532Q9HCE3 1301 aa28.43■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PDE6AP16499 860 aa28.42■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.42■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1B0GUL6 1792 aa28.42■■■□□ 2.14
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