RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625282.2

SPTAN1-210, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 4,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-210ENST00000625282 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF735P0CB33 412 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ASCL1P50553 236 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF136P52737 540 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM64Q6YI46 380 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 TVP23CQ96ET8 276 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 SCN5AQ14524 2016 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 XKRY2A2RUG3 117 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 METTL12A8MUP2 240 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 XKRYO14609 159 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 DVL1O14640 695 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 S100A7P31151 101 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 H3F3AP84243 136 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 GPR173Q9NS66 373 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.1□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 PTPRDP23468 1912 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 A6NIZ1 184 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 DNAJB6O75190 326 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 GNB3P16520 340 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM11P17152 192 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 S1PR1P21453 382 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 CTHP32929 405 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 TDGF1P3P51864 188 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 RAP1BP61224 184 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 IQCJQ1A5X6 159 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR18Q8N4B5 295 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 NECAP1Q8NC96 275 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 EXTL1Q92935 676 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 LYSMD1Q96S90 227 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 STARD10Q9Y365 291 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR32B1ATL7 298 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 AGR2O95994 175 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 HLA-GP17693 338 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC6A9P48067 706 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 BTN3A2P78410 334 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 TLE4Q04727 773 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM189A2Q15884 450 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF550Q7Z398 422 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 WDR34Q96EX3 536 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 SDF2Q99470 211 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 RAB18Q9NP72 206 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 MYOTQ9UBF9 498 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.09□□□□□ -1.11
SPTAN1-210ENST00000625282 EPOPA6NHQ4 379 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 XRCC2O43543 280 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 F13BP05160 661 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 MELTFP08582 738 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 HKR1P10072 659 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 GRK6P43250 576 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 HNF4GQ14541 408 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 COX15Q7KZN9 410 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 ARRDC3Q96B67 414 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SPACA7Q96KW9 195 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 OR51B6Q9H340 312 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.09□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.08□□□□□ -1.12
SPTAN1-210ENST00000625282 C4orf47A7E2U8 309 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms