RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 SGCDQ92629 289 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 GGHQ92820 318 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 SGK3Q96BR1 496 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 HAVCR1Q96D42 359 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 RNFT2Q96EX2 444 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZNF799Q96GE5 643 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 LYZL4Q96KX0 146 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 MNTQ99583 582 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 APOL4Q9BPW4 351 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 TEX12Q9BXU0 123 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 BEX2Q9BXY8 128 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 OR51B6Q9H340 312 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 LRP12Q9Y561 859 aa6.33□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 A0A1B0GTI1 187 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 B9A039 149 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 C22orf46C9J442 243 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 F5H5K5 113 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 H3BSA7 217 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 H7C417 338 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 PSMD9O00233 223 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 XPNPEP2O43895 674 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ADH4P08319 380 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 SLC2A1P11166 492 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 CCNOP22674 350 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 CDKN1AP38936 164 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 VHLP40337 213 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 RAD52P43351 418 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 FABP6P51161 128 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 PRKXP51817 358 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 CXCR4P61073 352 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 IL5RAQ01344 420 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZNF92Q03936 586 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZNF124Q15973 351 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 CDONQ4KMG0 1287 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 DRAM2Q6UX65 266 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 THEM6Q8WUY1 208 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 RORBQ92753 470 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 RFKQ969G6 155 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 SYT3Q9BQG1 590 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 GCM1Q9NP62 436 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 CENPMQ9NSP4 180 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 FZR1Q9UM11 496 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.32□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.42e-13■■■■■ 34.3
NOP56-211ENST00000471023 A0A096LNT2 108 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 E9PI62 339 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 NDUFS8O00217 210 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 FAM20BO75063 409 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ZNF254O75437 659 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 SULT1C4O75897 302 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 NCR1O76036 304 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 LALBAP00709 142 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 TTRP02766 147 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 HTR1AP08908 422 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 TUBG1P23258 451 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ALDH3B1P43353 468 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 KIR3DL2P43630 455 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 CX3CR1P49238 355 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 RGS6P49758 472 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 GZMKP49863 264 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 PPOXP50336 477 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 ETV1P50549 477 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 EFNA4P52798 201 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 TPTEP56180 551 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-211ENST00000471023 GALK2Q01415 458 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 166.4 ms