RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 SPTSSAQ969W0 71 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 PRRC1Q96M27 445 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 NUAK2Q9H093 628 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 TCF19Q9Y242 345 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GW55 424 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PPE2 198 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PPH5 198 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PR64 198 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PRV1 198 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 IFNW1P05000 195 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DUX4L2P0CJ85 424 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DUX4L3P0CJ86 424 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DUX4L4P0CJ87 422 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DUX4L5P0CJ88 424 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DUX4L6P0CJ89 424 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DUX4L7P0CJ90 424 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CENPAP49450 140 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 MTPNP58546 118 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 HCP5Q6MZN7 132 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DPY19L4Q7Z388 723 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 PIGWQ7Z7B1 504 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CROCCP2Q86T23 111 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 NAA40Q86UY6 237 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 C11orf53Q8IXP5 236 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 OR10A6Q8NH74 314 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 MUC7Q8TAX7 377 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CCDC28BQ9BUN5 200 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CHID1Q9BWS9 393 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 INPP5EQ9NRR6 644 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 HAO2Q9NYQ3 351 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DUX4Q9UBX2 424 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 RYR2Q92736 4967 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PRX2 142 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 M0R135 149 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 OR1E2P47887 323 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 SLC18A1P54219 525 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 WDR4P57081 412 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ZNF92Q03936 586 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 TRAM2Q15035 370 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 OTPQ5XKR4 325 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 STUMQ69YW2 141 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 SLC18B1Q6NT16 456 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CORO6Q6QEF8 472 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 WDR82Q6UXN9 313 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ZNF788Q6ZQV5 615 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 RRM2BQ7LG56 351 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CPLX4Q7Z7G2 160 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ANKRD42Q8N9B4 389 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CYB561A3Q8NBI2 242 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 OR1M1Q8NGA1 313 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 OR13C2Q8NGS9 318 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 RPS4Y2Q8TD47 263 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ZNF799Q96GE5 643 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 SH3GL1Q99961 368 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 FNDC11Q9BVV2 318 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 NRIP3Q9NQ35 241 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ABCB10Q9NRK6 738 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 A4GNTQ9UNA3 340 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 RAMP3O60896 148 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 NDUFB2O95178 105 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 NDUFB7P17568 137 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 TNFRSF1BP20333 461 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 SPIBQ01892 262 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DRAM2Q6UX65 266 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 OR10Z1Q8NGY1 313 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 TSPEARQ8WU66 669 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 OR5M11Q96RB7 305 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 TMEM5Q9Y2B1 443 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 LRP12Q9Y561 859 aa12.1□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 A6NDX4 124 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ANGPT2O15123 496 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 SIGLEC5O15389 551 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 SYNGR1O43759 233 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 TXNDC12O95881 172 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 AMY2BP19961 511 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 GZMMP51124 257 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 RPS6KA3P51812 740 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 SELPLGQ14242 412 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 RFX4Q33E94 735 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ERICH5Q6P6B1 374 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 ZNF730Q6ZMV8 503 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 CFAP77Q6ZQR2 320 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 OFCC1Q8IZS5 231 aa12.09□□□□□ -0.47
NELFE-204ENST00000436289 OR4C15Q8NGM1 316 aa12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms