RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBE2CO00762 179 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCR3O14931 201 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC175P0C221 793 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPMP14384 443 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 PGCP20142 388 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K8P41279 467 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAP1GDS1P52306 607 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC40Q4G0X9 1142 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM17Q86X19 198 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR6K6Q8NGW6 343 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 APH1AQ96BI3 265 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 C12orf66Q96MD2 445 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM38BQ9NVV0 291 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R9Q9NYW1 312 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCAP29Q9UHQ4 241 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB22AQ9UL26 194 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 COPS3Q9UNS2 423 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL27Q9Y4X3 112 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL18A1P39060 1754 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBN2Q6ZU65 1347 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 VWFP04275 2813 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC69A6NI79 296 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 MGRN1O60291 552 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 PFKFB2O60825 505 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 SURF6O75683 361 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1D-12P01611 117 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD2P06729 351 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD36P16671 472 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 OSTNP61366 133 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 MXD1Q05195 221 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 GANABQ14697 944 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 HFEQ30201 348 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNJQ5T5M9 372 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5AU1Q8NGC0 362 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR52M1Q8NGK5 317 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10G6Q8NH81 332 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF2Q99496 336 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 AIPL1Q9NZN9 384 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 MROH5Q6ZUA9 1318 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF532Q9HCE3 1301 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa-2.71□□□□□ -2.84
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RNU6-871P-201ENST00000516122 M0R378 163 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSD17B6O14756 317 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAAR5O14804 337 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP-2.71□□□□□ -2.84
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RNU6-871P-201ENST00000516122 RAD52P43351 418 aa-2.71□□□□□ -2.84
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL15Q16663 113 aa-2.71□□□□□ -2.84
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRSS42Q7Z5A4 293 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPXCR1Q8N123 301 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFP82Q8N141 532 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 DHRSXQ8N5I4 330 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR7G3Q8NG95 312 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10R2Q8NGX6 335 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 UFD1Q92890 307 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100PBPQ96BU1 408 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAMD8Q96LT4 415 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 RDH14Q9HBH5 336 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXL3Q9UKT7 428 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 MED12LQ86YW9 2145 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM26A0A096LP01 95 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZW10O43264 779 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2T1O43869 369 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF682O95780 498 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV2-5P01817 119 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPSAP08865 295 aaKnown RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL11P20809 199 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 USF1P22415 310 aaPredicted RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL12AP29459 219 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 BMI1P35226 326 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC26A5P58743 744 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLINT1Q14677 625 aa-2.72□□□□□ -2.84
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