RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 CRLF3Q8IUI8 442 aa4.53□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 NECAP1Q8NC96 275 aa4.53□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 OR6X1Q8NH79 312 aa4.53□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 GTSF1Q8WW33 167 aa4.53□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 TMEM230Q96A57 120 aa4.53□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 SGTBQ96EQ0 304 aa4.53□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 COPS4Q9BT78 406 aa4.53□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.53□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 TREX1Q9NSU2 369 aa4.53□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.53□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 ACOT9Q9Y305 439 aa4.53□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 H7C1H1 209 aa4.52□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 ZNF432O94892 652 aa4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 SLC25A1P53007 311 aa4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.52□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 FAM151BQ6UXP7 276 aa4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 Q6ZT83 130 aa4.52□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 NPWQ8N729 165 aa4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 OR8J2Q8NGG1 315 aa4.52□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 GABRG3Q99928 467 aa4.52□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 AIG1Q9NVV5 245 aa4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 ASF1AQ9Y294 204 aa4.52□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 RGS12O14924 1447 aa4.51□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 ITSN1Q15811 1721 aa4.51□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 IGHV3-23P01764 117 aa4.51□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.51□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 CGB2Q6NT52 195 aa4.51□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 CLEC18BQ6UXF7 455 aa4.51□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 FAM71AQ8IYT1 594 aa4.51□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 CA13Q8N1Q1 262 aa4.51□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.51□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.51□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 RNF145Q96MT1 663 aa4.51□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa4.51□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.51□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 SLC25A15Q9Y619 301 aa4.51□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 A0A0A6YYH2 397 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 A6NJ64 397 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 H7C2Y5 167 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 EDIL3O43854 480 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 CCDC166P0CW27 439 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 OR5H8P0DN80 308 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 CD37P11049 281 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 PSKH1P11801 424 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 BLVRAP53004 296 aa4.5□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 TSPAN5P62079 268 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 REG3AQ06141 175 aa4.5□□□□□ -1.69
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MDM2-201ENST00000258148 PAGE3Q5JUK9 113 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 ANKRD22Q5VYY1 191 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 P2RY8Q86VZ1 359 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 LRRC6Q86X45 466 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.5□□□□□ -1.69
MDM2-201ENST00000258148 OR2L2Q8NH16 312 aa4.5□□□□□ -1.69
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