RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 PDCD5O14737 125 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR10H3O60404 316 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZG16O60844 167 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 B4GALT2O60909 372 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 NME6O75414 186 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RDH16O75452 317 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZFAND5O76080 213 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 B3GAT3O94766 335 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 NDUFB6O95139 128 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CD8AP01732 235 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RHOCP08134 193 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 UCHL1P09936 223 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 POU2F1P14859 743 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 HLA-GP17693 338 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 GIFP27352 417 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 IMPA1P29218 277 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 AQP1P29972 269 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TRIM23P36406 574 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 IFNGR2P38484 337 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CD79BP40259 229 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RFC3P40938 356 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 PMELP40967 661 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CCR8P51685 355 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 AP3S2P59780 193 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TSPAN5P62079 268 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZNF345Q14585 488 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 GANABQ14697 944 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 FCRLAQ7L513 359 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 COMMD6Q7Z4G1 85 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 GPR142Q7Z601 462 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 HOGA1Q86XE5 327 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 GID4Q8IVV7 300 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 PDZD9Q8IXQ8 264 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TOMM5Q8N4H5 51 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CLDN19Q8N6F1 224 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 AMER3Q8N944 861 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR1M1Q8NGA1 313 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR4K5Q8NGD3 323 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 FIBINQ8TAL6 211 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 FBXO32Q969P5 355 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TMEM203Q969S6 136 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 PPCDCQ96CD2 204 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CXorf58Q96LI9 332 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZNF607Q96SK3 696 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 PINK1Q9BXM7 581 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 EBPLQ9BY08 206 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 C20orf85Q9H1P6 137 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RHBGQ9H310 441 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 C1orf198Q9H425 327 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 MCCC2Q9HCC0 563 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 HRASLSQ9HDD0 168 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CTPS2Q9NRF8 586 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 HPF1Q9NWY4 346 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CTSFQ9UBX1 484 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 IL36AQ9UHA7 158 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OPN4Q9UHM6 478 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZNF222Q9UK12 451 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 NINQ8N4C6 2090 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.26□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TRAV18A0A075B6X5 111 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 A0A0B4J203 849 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 E7EQ34 232 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 NPIPA3F8WFD2 350 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 H3BN98 237 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TEX46H3BTG2 121 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 HMGN4O00479 90 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 FGF16O43320 207 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SDC3O75056 442 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TSC22D2O75157 780 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 REM1O75628 298 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RP2O75695 350 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SOX14O95416 240 aa4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms