RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522638.1

IGKV3D-34-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 3D-34 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV3D-34, Length 302 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR8U1Q8NH10 309 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MALSU1Q96EH3 234 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TMEM19Q96HH6 336 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GAFA1Q96PS6 74 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 WFDC6Q9BQY6 131 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LIN7BQ9HAP6 207 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 EMC7Q9NPA0 242 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 POLE4Q9NR33 117 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ASIC5Q9NY37 505 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CALML5Q9NZT1 146 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 A0A0G2JPF8 293 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GMNCA6NCL1 334 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CCDC154A6NI56 674 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CH25HO95992 272 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHEK2O96017 543 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FGF4P08620 206 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TSPAN19P0C672 248 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PGA5P0DJD9 388 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MYL2P10916 166 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FSTP19883 344 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CA6P23280 308 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GCAP28676 217 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DAP3P51398 398 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LGALS4P56470 323 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ECH1Q13011 328 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KIR2DS1Q14954 304 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SEC23BQ15437 767 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR1Q1Q15612 314 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR8G1Q15617 311 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SSX2Q16385 188 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MICBQ29980 383 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CFAP157Q5JU67 520 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SPANXN4Q5MJ08 99 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FAM27D1Q5T7N8 215 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ANXA8L1Q5VT79 327 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RNLSQ5VYX0 342 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF626Q68DY1 528 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TMEM65Q6PI78 240 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HDDC2Q7Z4H3 204 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LYPD6Q86Y78 171 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LRRC29Q8WV35 223 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 WACQ9BTA9 647 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 BCL2L10Q9HD36 194 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ISYNA1Q9NPH2 558 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C19orf12Q9NSK7 152 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ADA2Q9NZK5 511 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 BTNL2Q9UIR0 455 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF232Q9UNY5 417 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 IFT52Q9Y366 437 aa4.59□□□□□ -1.67
IGKV3D-34-201ENST00000522638 A0A1W2PPL8 197 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 A0A1W2PRG6 482 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 A6NLC8 198 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MCIDASD6RGH6 385 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SIGLEC5O15389 551 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TPST1O60507 370 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GMDSO60547 372 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FMO6PO60774 539 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GLCEO94923 617 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHRNGP07510 517 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PHBP35232 272 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SLC25A1P53007 311 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MXRA7P84157 204 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PRR20EP86478 221 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PRR20CP86479 221 aa4.58□□□□□ -1.68
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PRR20DP86480 221 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms