RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.37□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.37□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 H0YAE9 185 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CD5LO43866 347 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 DOK2O60496 412 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 RAB36O95755 333 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 SBK2P0C263 348 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 TTKP33981 857 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 THBS2P35442 1172 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 GLRXP35754 106 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CAPGP40121 348 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CDH11P55287 796 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 ROM1Q03395 351 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 ZNF85Q03923 595 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 TMED1Q13445 227 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 EFNB3Q15768 340 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 KLHL12Q53G59 568 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 GJC3Q8NFK1 279 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 DOK1Q99704 481 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 C1orf198Q9H425 327 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 RNF121Q9H920 327 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CA10Q9NS85 328 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 STARD10Q9Y365 291 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 A0A1B0GWJ7 208 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 C5orf49A4QMS7 147 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 RNF212BA8MTL3 300 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 APOL3O95236 402 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CLPTM1O96005 669 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 PNPP00491 289 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 IGLV3-1P01715 115 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CRYAAP02489 173 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 SPARCP09486 303 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 FAM157CP0CG43 387 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 ZNF250P15622 560 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 FPR2P25090 351 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 MPV17P39210 176 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 HTR5AP47898 357 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 UCP2P55851 309 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CDC42P60953 191 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 ZNF91Q05481 1191 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 ZNF544Q6NX49 715 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 SLC22A25Q6T423 547 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 SHFQ7M4L6 423 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 GID4Q8IVV7 300 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 LGALS12Q96DT0 336 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 C4orf45Q96LM5 186 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 OR8B4Q96RC9 309 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 PLK3Q9H4B4 646 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.35□□□□□ -1.39
NOP56-211ENST00000471023 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms