RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 APOC1P02654 83 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SBK2P0C263 348 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 GSTT2P0CG29 244 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 GSTT2BP0CG30 244 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ALOX5APP20292 161 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 DCTDP32321 178 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SLC15A1P46059 708 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 HSPA13P48723 471 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SMUG1Q53HV7 270 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OTPQ5XKR4 325 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 DRAM2Q6UX65 266 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 USP51Q70EK9 711 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 TFAP2CQ92754 450 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SPTSSAQ969W0 71 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 C4orf45Q96LM5 186 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 KCNJ15Q99712 375 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ABHD6Q9BV23 337 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 NIPAL2Q9H841 368 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PALMDQ9NP74 551 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CLN6Q9NWW5 311 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 B9A039 149 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RNF223E7ERA6 249 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ENTPD6O75354 484 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ZNF254O75437 659 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ABHD16AO95870 558 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ACSM4P0C7M7 580 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OR2T7P0C7T2 308 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 BMP4P12644 408 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CCL2P13500 99 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ZNF250P15622 560 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CCNOP22674 350 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 S100A5P33763 92 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 THBS4P35443 961 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SERPINF1P36955 418 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OPRL1P41146 370 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 WNT5AP41221 380 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MTNR1AP48039 350 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 AQP4P55087 323 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 TPTEP56180 551 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ISL1P61371 349 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ACTC1P68032 377 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ACTA1P68133 377 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ROM1Q03395 351 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ADIPOQQ15848 244 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 KRT80Q6KB66 452 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OR2T27Q8NH04 317 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 APH1BQ8WW43 257 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CYGBQ8WWM9 190 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 UBE2FQ969M7 185 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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GGA3-209ENST00000580646 REG4Q9BYZ8 158 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 TPK1Q9H3S4 243 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 PLK3Q9H4B4 646 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 Q9H521 79 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SP140LQ9H930 580 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 CMAHPQ9Y471 501 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 IRGMA1A4Y4 181 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 J3QRE1 110 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 M0R135 149 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 SSX4O60224 188 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 DBHP09172 617 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 OR4A8P0C604 315 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 IL5RAQ01344 420 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 EGR3Q06889 387 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-209ENST00000580646 RAB40BQ12829 278 aa8.48□□□□□ -1.05
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