RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFP3Q96NJ6 502 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NRIP2Q9BQI9 281 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VNN3Q9NY84 501 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VAPAQ9P0L0 249 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCYOX1Q9UHG3 505 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AK9Q5TCS8 1911 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.58□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 PEX7O00628 323 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFAIP8O95379 198 aa3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDKN2BP42772 138 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAV2P51636 162 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TDGF1P3P51864 188 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF138P52744 262 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC7A9P82251 487 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTLL9Q3SXZ7 439 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C5orf47Q569G3 176 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THEM4Q5T1C6 240 aa3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR4S2Q8NH73 311 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMIM10Q96HG1 83 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM101Q96IK0 257 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTRCQ99895 268 aa3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 DEC1Q9P2X7 70 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNRQ92752 1358 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPIPB7O75200 414 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RCBTB2O95199 551 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD1EP15812 388 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLET1Q6UQ28 207 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPGNQ6UW88 154 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q6ZVH6 145 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STPG2Q8N412 459 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR26Q8NDV2 337 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR2L8Q8NGY9 312 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRAPQ8TCY5 172 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC45Q96CN5 670 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.55□□□□□ -1.84
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