RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 HSD17B8Q92506 261 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 S100PBPQ96BU1 408 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 FBXO17Q96EF6 278 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 C4orf36Q96KX1 117 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CENPMQ9NSP4 180 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 COPS3Q9UNS2 423 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LRP12Q9Y561 859 aa8.46□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 J3QLW9 94 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 RER1O15258 196 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 AGFG2O95081 481 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 HLA-HP01893 362 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LIMS3P0CW19 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LIMS4P0CW20 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CPEP16870 476 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF19P17023 458 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PSMB9P28065 219 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CCKARP32238 428 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SLC6A9P48067 706 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ETV1P50549 477 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 NR1H2P55055 460 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TPTEP56180 551 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 RAB1AP62820 205 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H3AP68431 136 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF85Q03923 595 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 IRF3Q14653 427 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SPHARQ15513 63 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 NEDD8Q15843 81 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC58Q4VC31 144 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LHFPL3Q86UP9 236 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 MDP1Q86V88 176 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 HTRA1Q92743 480 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 UFD1Q92890 307 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 DOK1Q99704 481 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 MED18Q9BUE0 208 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 IFT22Q9H7X7 185 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.45□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 M0R135 149 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SYNGR3O43761 229 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZG16O60844 167 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV3-15P01624 115 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 HSMCR30P0CW71 290 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM18P0DKX4 95 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PSKH1P11801 424 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CBR1P16152 277 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 STOMP27105 288 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TGM4P49221 684 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 CX3CR1P49238 355 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 RGS6P49758 472 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PSG4Q00888 419 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 PIGFQ07326 219 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ACSM1Q08AH1 577 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TIGD6Q17RP2 521 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 TP53I3Q53FA7 332 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 OTPQ5XKR4 325 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF774Q6NX45 483 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 DRAM2Q6UX65 266 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SSX6Q7RTT6 188 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 SGCDQ92629 289 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 THRSPQ92748 146 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF799Q96GE5 643 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 COG8Q96MW5 612 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.44□□□□□ -1.06
CTPS1-211ENST00000497210 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.44□□□□□ -1.06
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