RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	NDE1	Q9NXR1	346 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	TVP23A	A6NH52	213 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464		F5H5K5	113 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	TNFRSF11B	O00300	401 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	KRT36	O76013	467 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF205	O95201	554 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	HLA-DPB1	P04440	258 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	T-ENOL	P0DO92	83 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CFP	P27918	469 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	NOS3	P29474	1203 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	GATA4	P43694	442 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	MS4A2	Q01362	244 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF154	Q13106	437 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	PCK2	Q16822	640 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	LCN8	Q6JVE9	175 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	LNX2	Q8N448	690 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464		Q8TCH9	128 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	PITX2	Q99697	317 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R135	149 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CD200	P41217	278 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	PAX8	Q06710	450 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CRMP1	Q14194	572 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF404	Q494X3	552 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00471	Q8N535	108 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF799	Q96GE5	643 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF69	Q9UC07	566 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	AUP1	Q9Y679	476 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464		B2RBV5	119 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	HAX1	O00165	279 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CCNB2	O95067	398 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	SOX14	O95416	240 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	HLA-DQA2	P01906	255 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	LCAT	P04180	440 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	GYPB	P06028	91 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CLU	P10909	449 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	SPI1	P17947	270 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CD80	P33681	288 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	MXRA7	P84157	204 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF92	Q03936	586 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	MPPED2	Q15777	294 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ESCO2	Q56NI9	601 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	KLB	Q86Z14	1044 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2T4	Q8NH00	348 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM100	Q9NV29	134 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CD300LB	A8K4G0	201 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	TRIM77	I1YAP6	450 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ACOT8	O14734	319 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM20B	O75063	409 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	CPT2	P23786	658 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	MNAT1	P51948	309 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC25A1	P53007	311 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	TPTE	P56180	551 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	ACTG1	P63261	375 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PTPRF-211	ENST00000467464	MICA	Q29983	383 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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