RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 SPATC1Q76KD6 591 aa17.39■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 C18orf12Q96KH6 178 aa17.39■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 MNTQ99583 582 aa17.39■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ADGRL4Q9HBW9 690 aa17.39■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 LAMP5Q9UJQ1 280 aa17.39■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa17.39■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 NDUFS8O00217 210 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 DLGAP1O14490 977 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 NCR1O76036 304 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 H2BFMP0C1H6 154 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 DAOP14920 347 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 HSD11B1P28845 292 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 MALLQ13021 153 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 TMED1Q13445 227 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SNAI3Q3KNW1 292 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 FAM209AQ5JX71 171 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF786Q8N393 782 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 PACRGLQ8N7B6 248 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF283Q8N7M2 679 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 UBASH3BQ8TF42 649 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 RFKQ969G6 155 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 DCLRE1BQ9H816 532 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 FAM118AQ9NWS6 357 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 GMPPBQ9Y5P6 360 aa17.38■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SLC16A6O15403 523 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 IGHV1-46P01743 117 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 HPXP02790 462 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SLC25A16P16260 332 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ANOS1P23352 680 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 MAGEB1P43366 347 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 CX3CR1P49238 355 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 HCCSP53701 268 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 POU4F2Q12837 409 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 CDK5R2Q13319 367 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 LPCAT4Q643R3 524 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 DEGS2Q6QHC5 323 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 PRSS45Q7RTY3 260 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ASB17Q8WXJ9 295 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 UBE2FQ969M7 185 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 DIRC2Q96SL1 478 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 REG4Q9BYZ8 158 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 NIPAL2Q9H841 368 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SP140LQ9H930 580 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 COPS3Q9UNS2 423 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 CR1P17927 2039 aa17.37■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ZANQ9Y493 2812 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 A0A096LNT2 108 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 IQCF6A8MYZ5 107 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 VWC2LB2RUY7 222 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SBK2P0C263 348 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SELEP16581 610 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 GIFP27352 417 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 PEX2P28328 305 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ROM1Q03395 351 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 OCLNQ16625 522 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 OR2T2Q6IF00 324 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 LRRN1Q6UXK5 716 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 Q6ZR03 302 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SLC35F2Q8IXU6 374 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 OPA3Q9H6K4 179 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 MSL2Q9HCI7 577 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 CLN6Q9NWW5 311 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 MTORP42345 2549 aa17.36■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 C5orf63A6NC05 138 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 RNF223E7ERA6 249 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 PHYHO14832 338 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SPRY3O43610 288 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 CD55P08174 381 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 INHBBP09529 407 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SLC2A1P11166 492 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 GABRB1P18505 474 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 CCL8P80075 99 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF92Q03936 586 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 LRRC36Q1X8D7 754 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 GLYATL3Q5SZD4 288 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 PGAP1Q75T13 922 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 KRT77Q7Z794 578 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 GALNT4Q8N4A0 578 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 OR8G5Q8NG78 346 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 OR51G2Q8NGK0 314 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 RDH5Q92781 318 aa17.35■□□□□ 0.37
CLDN3-201ENST00000395145 SPSB4Q96A44 273 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms