RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358355.5

USP20-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,371 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-202ENST00000358355 FZD5Q13467 585 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 CBLN3Q6UW01 205 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 REEP6Q96HR9 211 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SPTBP11277 2137 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 MSTNO14793 375 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 GALNSP34059 522 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 DDOSTP39656 456 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 STARD6P59095 220 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 BLOC1S1P78537 153 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 C12orf73Q69YU5 71 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 M1APQ8TC57 530 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 LOXL4Q96JB6 756 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OR5B12Q96R08 314 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OR8B4Q96RC9 309 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 A0A1W2PPV4 95 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 IFITM5A6NNB3 132 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SH2D1BO14796 132 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 GLAP06280 429 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 UBE3DQ7Z6J8 389 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 VASH2Q86V25 355 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 DEFB108BQ8NET1 73 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OTOSQ8NHW6 89 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SEH1LQ96EE3 360 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 VSTM2LQ96N03 204 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SPACA5Q96QH8 159 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OPA3Q9H6K4 179 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 LRP5LA4QPB2 252 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 PTGS2P35354 604 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 RAB1AP62820 205 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 WDSUB1Q8N9V3 476 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OR10K1Q8NGX5 313 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 PP6455Q8WZ26 134 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 GCM1Q9NP62 436 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 K7EPK0 472 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 PNLIPP16233 465 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 HTR2BP41595 481 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OTPQ5XKR4 325 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 RDH5Q92781 318 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 CYR61O00622 381 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 ARID2Q68CP9 1835 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 TRILQ7L0X0 811 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 LGI3Q8N145 548 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 CCL27Q9Y4X3 112 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SCN3AQ9NY46 2000 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 HS3ST1O14792 307 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 TUSC2O75896 110 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 GLRA1P23415 457 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 PSG6Q00889 435 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 FABP5Q01469 135 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 RTTNQ86VV8 2226 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 PMP2P02689 132 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 CD82P27701 267 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 CD79BP40259 229 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 FUT7Q11130 342 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 TAF9Q16594 264 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SFRP5Q5T4F7 317 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa11.58□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 MDGA2Q7Z553 956 aa11.58□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OR10D3Q8NH80 312 aa11.58□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OR1F12Q8NHA8 337 aa11.58□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SDSLQ96GA7 329 aa11.58□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 SEC22AQ96IW7 307 aa11.58□□□□□ -0.55
USP20-202ENST00000358355 OR5H15A6NDH6 313 aa11.58□□□□□ -0.56
USP20-202ENST00000358355 PMS2P2O95744 297 aa11.58□□□□□ -0.56
USP20-202ENST00000358355 CDAP32320 146 aa11.58□□□□□ -0.56
USP20-202ENST00000358355 SORDQ00796 357 aa11.58□□□□□ -0.56
USP20-202ENST00000358355 RNLSQ5VYX0 342 aa11.58□□□□□ -0.56
USP20-202ENST00000358355 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms