RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 DCTN6O00399 190 aa9.98□□□□□ -0.81
CAPNS1-209ENST00000590049 PHYHO14832 338 aa9.98□□□□□ -0.81
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CAPNS1-209ENST00000590049 APOL3O95236 402 aa9.98□□□□□ -0.81
CAPNS1-209ENST00000590049 LYNP07948 512 aa9.98□□□□□ -0.81
CAPNS1-209ENST00000590049 SPARCP09486 303 aa9.98□□□□□ -0.81
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CAPNS1-209ENST00000590049 MPGP29372 298 aa9.98□□□□□ -0.81
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CAPNS1-209ENST00000590049 EPHA1P21709 976 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ACTA2P62736 377 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ACTG2P63267 376 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 P2RY6Q15077 328 aa9.96□□□□□ -0.82
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