RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MOSP00540 346 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 P0C879 139 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARL2P36404 184 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HCCSP53701 268 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIMM10P62072 90 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VSNL1P62760 191 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DGCR6Q14129 220 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RFX4Q33E94 735 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFP90Q8TF47 636 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF145Q96MT1 663 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SERPINB11Q96P15 392 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLEKHF1Q96S99 279 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CIB1Q99828 191 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GABRG3Q99928 467 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMLR1H3BR10 107 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H7C2Y5 167 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOR1AO14656 332 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM189A1O60320 539 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MMP23AO75900 390 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB3DO95716 219 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FABP3P05413 133 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RETP07949 1114 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RD3LP0DJH9 198 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LIPCP11150 499 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGAM1P18669 254 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB3BP20337 219 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GABRR1P24046 479 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNASE1L1P49184 302 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBE2E1P51965 193 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST3GAL4Q11206 333 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCP10Q12799 353 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C15orf32Q32M92 178 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSX6Q7RTT6 188 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB43Q86YS6 212 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD177Q8N6Q3 437 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPWQ8N729 165 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR2T29Q8NH02 315 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC58Q96CX6 371 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM122AQ96E09 287 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OSBPL11Q9BXB4 747 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCML1Q9UN30 329 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC22A14Q9Y267 594 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFP92A6NM28 416 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F8VP50 259 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGA8RI6L899 631 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERGP11308 486 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF30P17039 623 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FUT3P21217 361 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD40LGP29965 261 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNRHRP30968 328 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEACAM6P40199 344 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGEA6P43360 314 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPICP45877 212 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HCAR3P49019 387 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRLHRP49683 370 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAS2R39P59534 338 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1CBP62140 327 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CACNG7P62955 275 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 QPRTQ15274 297 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STRADAQ7RTN6 431 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM234Q8WY98 164 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C16orf74Q96GX8 76 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms