RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 GALNT14Q96FL9 552 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBATAQ96M53 351 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPM1MQ96MI6 270 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 OXGR1Q96P68 337 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCGF6Q9BYE7 350 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP3A43Q9HB55 503 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNJ16Q9NPI9 418 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PGAP2Q9UHJ9 254 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 DSCAML1Q8TD84 2053 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC7Q96M83 1385 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0B4J2A0 478 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 STX7O15400 261 aaKnown RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUX1O43812 170 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 B3GAT3O94766 335 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1D-33P01593 117 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1-33P01594 117 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNB1P14635 433 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB3BP20337 219 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXA6P31267 233 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERPINB5P36952 375 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 NNMTP40261 264 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP5CP53041 499 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYNJ2BPP57105 145 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 RCAN2Q14206 197 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 GK3PQ14409 553 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPN20Q4JDL3 420 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM205BPQ63HN1 556 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 UTS2BQ765I0 119 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC45BQ8IWX7 931 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 ORMDL3Q8N138 153 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEP112Q8N8E3 955 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00526Q96FQ7 95 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM38AQ9H6F2 299 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 ECT2Q9H8V3 914 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 MORF4L1Q9UBU8 362 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHPKQ9UHJ6 478 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS28Q9UK41 221 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMCC3Q9ULS5 477 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRIN2BQ13224 1484 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHD6Q8TD26 2715 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 F8W036 122 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TP53I11O14683 189 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 NVLO15381 856 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHMP2AO43633 222 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 NME2P1O60361 137 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMPD2O60906 423 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERPINB7O75635 380 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD3DP04234 171 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDKN1BP46527 198 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERVK-25P63136 954 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 NME3Q13232 169 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC8BQ6P9F7 803 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNSTQ6PJW8 725 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM54Q969K7 222 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 MED8Q96G25 268 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCHPQ9BT92 498 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLN8Q9UBY8 286 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMED5Q9Y3A6 229 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPRKQ15262 1439 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITPR3Q14573 2671 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRMPD4Q14CM0 1322 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 KDM6BO15054 1643 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF222A6NCQ9 220 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR6C74A6NCV1 312 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BMM0 161 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 RS1O15537 224 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTI1O43156 1089 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOM1O60784 492 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOD3P08294 240 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSTT2P0CG29 244 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSTT2BP0CG30 244 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTLA4P16410 223 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATF1P18846 271 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAPN3P20807 821 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 DRD5P21918 477 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCK1P35558 622 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF137PP52743 207 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFNA4P52798 201 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PKNOX1P55347 436 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNOCQ13519 176 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAMK2DQ13557 499 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
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