RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SPINK14Q6IE38 97 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SIAH3Q8IW03 269 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SLC7A6Q92536 515 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A28Q96A46 364 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SFXN2Q96NB2 322 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 IL17BQ9UHF5 180 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ALG5Q9Y673 324 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF716A6NP11 495 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 RER1O15258 196 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 DHHO43323 396 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 XRCC3O43542 346 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 LMX1BO60663 402 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 TRAPPC6AO75865 159 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 KRT33AO76009 404 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 WDPCPO95876 746 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 F10P00742 488 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ARSBP15848 533 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 HTR2CP28335 458 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SELENOPP49908 381 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 GFRA1P56159 465 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 CARD18P57730 90 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 TAS2R20P59543 309 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 LYPD6Q86Y78 171 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 OR52I2Q8NH67 350 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 NKD1Q969G9 470 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 NABP1Q96AH0 204 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 COPZ2Q9P299 210 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ABI3Q9P2A4 366 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01387J3KSC0 135 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SYT7O43581 403 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 CTAG2O75638 210 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 CTSSP25774 331 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ITGA3P26006 1051 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 CLDN15P56746 228 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 TAF13Q15543 124 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 MTFR2Q6P444 385 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 OR2M7Q8NG81 312 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 RCE1Q9Y256 329 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 MGAQ8IWI9 3026 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GTI1 187 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 CIB4A0PJX0 185 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ACOT7O00154 380 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 CXCL13O43927 109 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 TCRBP04435 133 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 HPNP05981 417 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 CX3CR1P49238 355 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 STARP49675 285 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 PRKXP51817 358 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 EFNB2P52799 333 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 AP3S2P59780 193 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H3AP68431 136 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 SGCAQ16586 387 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms