RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 INTS14Q96SY0 518 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 TEX12Q9BXU0 123 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 S100A14Q9HCY8 104 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 MTORP42345 2549 aa13.41□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 M0R129 80 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 NDUFS8O00217 210 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 LY6G6DO95868 133 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 KITLGP21583 273 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 ANOS1P23352 680 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 CARTPTQ16568 116 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 SLC35D3Q5M8T2 416 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 FBXW12Q6X9E4 464 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 C10orf67Q8IYJ2 551 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 CMBLQ96DG6 245 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 COG8Q96MW5 612 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 GABARAPL3Q9BY60 117 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 PTTG3PQ9NZH4 202 aa13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ACTB-206ENST00000443528 CCDC182A6NF36 153 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 M0R135 149 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 SELENOFO60613 162 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 IGHV1-46P01743 117 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 COL8A2P25067 703 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 NR4A2P43354 598 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 ZNF81P51508 661 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 TPTEP56180 551 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 CCL8P80075 99 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 KRTAP1-1Q07627 177 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 APOFQ13790 326 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 OR5L1Q8NGL2 311 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 ZNF799Q96GE5 643 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 AMELYQ99218 206 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 PIMREGQ9BSJ6 248 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 ABHD6Q9BV23 337 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 CENPMQ9NSP4 180 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 ENOPH1Q9UHY7 261 aa13.39□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 C5orf63A6NC05 138 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 ZNF878C9JN71 531 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 EI24O14681 340 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 SPRY3O43610 288 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 MT-ND5P03915 603 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 ALPLP05186 524 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 RAC2P15153 192 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 GIFP27352 417 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 RIN1Q13671 783 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 PCGF3Q3KNV8 242 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 Q6ZR03 302 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 Q71RC1 249 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 SPATC1Q76KD6 591 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 SHFQ7M4L6 423 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 TCEANCQ8N8B7 351 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 RNF133Q8WVZ7 376 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 RDH5Q92781 318 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 YIPF5Q969M3 257 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 SPTSSAQ969W0 71 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 TEAD3Q99594 435 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 KCNJ15Q99712 375 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 COPS4Q9BT78 406 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 PRRG3Q9BZD7 231 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 BPESC1Q9GZL8 116 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 RIBC2Q9H4K1 309 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 MSL2Q9HCI7 577 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 CYSLTR2Q9NS75 346 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 USE1Q9NZ43 259 aa13.38□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 PLSCR5A0PG75 271 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 LCATP04180 440 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 HEXAP06865 529 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 ADH4P08319 380 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 LIPAP38571 399 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 PRKXP51817 358 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 RPS7P62081 194 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 CDK5R2Q13319 367 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 TSTQ16762 297 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 SNAI3Q3KNW1 292 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 AADACL4Q5VUY2 407 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 OR2T2Q6IF00 324 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 DRAM2Q6UX65 266 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 OTOSQ8NHW6 89 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 TMEM163Q8TC26 289 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 IL4I1Q96RQ9 567 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 NF1P21359 2839 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 CR1P17927 2039 aa13.37□□□□□ -0.27
ACTB-206ENST00000443528 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms