RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 PSG8Q9UQ74 426 aa2.75□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 TIMM22Q9Y584 194 aa2.75□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 RFNGQ9Y644 331 aa2.75□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 KCNE3Q9Y6H6 103 aa2.75□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 PTPRTO14522 1441 aa2.75□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SMCO3A2RU48 225 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 C7orf66A4D0T2 115 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 OR6C74A6NCV1 312 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 K7ERQ8 282 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 AIM2O14862 343 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 RAD51BO15315 384 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 BIRC5O15392 142 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 RP2O75695 350 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SRP72O76094 671 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 RCBTB2O95199 551 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 HLA-DRAP01903 254 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ZNF43P17038 809 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 GALP22466 123 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 RRM2P31350 389 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 AQP2P41181 271 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ACLYP53396 1101 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 TSPAN5P62079 268 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ACTG2P63267 376 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 DNAJC3Q13217 504 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 COTL1Q14019 142 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CASP8Q14790 479 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ARL9Q6T311 187 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 IGFL1Q6UW32 110 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CCDC121Q6ZUS5 278 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 OR2A1Q8NGT9 310 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 OR10J6PQ8NGY7 276 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CDC26Q8NHZ8 85 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 OPTNQ96CV9 577 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 LRRC39Q96DD0 335 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ZNF681Q96N22 645 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 BCL7BQ9BQE9 202 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SIKE1Q9BRV8 207 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 C9orf16Q9BUW7 83 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CWH43Q9H720 699 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 C12orf10Q9HB07 376 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 KCNJ16Q9NPI9 418 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 LZTFL1Q9NQ48 299 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 VANGL2Q9ULK5 521 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 DDX19BQ9UMR2 479 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 NSD2O96028 1365 aa2.74□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ERICH2A1L162 156 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 HEATR9A2RTY3 570 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CLIC3O95833 236 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 APOEP02649 317 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 HMGN1P05114 100 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CFL1P23528 166 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 DTYMKP23919 212 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 BMI1P35226 326 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 NSG1P42857 185 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ZNF836Q6ZNA1 936 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SLC51BQ86UW2 128 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ERO1BQ86YB8 467 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CALHM1Q8IU99 346 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ZNF615Q8N8J6 731 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 OR7G2Q8NG99 324 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 COQ8AQ8NI60 647 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SLC7A13Q8TCU3 470 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 OR10C1Q96KK4 312 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ATP5SQ99766 215 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 KCNS3Q9BQ31 491 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SELENOSQ9BQE4 189 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 CENPKQ9BS16 269 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 METTL7AQ9H8H3 244 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SIRT7Q9NRC8 400 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 GGA2Q9UJY4 613 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 HYOU1Q9Y4L1 999 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa2.73□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 ELP1O95163 1332 aa2.72□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 TTC41PQ6P2S7 1318 aa2.72□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 WDR19Q8NEZ3 1342 aa2.72□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SCRIBQ14160 1630 aa2.72□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 GOLGA8IPA6NC78 632 aa2.72□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 GOLGA8JA6NMD2 632 aa2.72□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 LYRM9A8MSI8 78 aa2.72□□□□□ -1.97
CSN3-201ENST00000304954 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms