RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 ACTR6Q9GZN1 396 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 RNF121Q9H920 327 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PRPF8-210ENST00000574217 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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PRPF8-210ENST00000574217 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.85□□□□□ -1.47
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PRPF8-210ENST00000574217 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.85□□□□□ -1.47
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PRPF8-210ENST00000574217 SGCEO43556 437 aa5.84□□□□□ -1.47
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PRPF8-210ENST00000574217 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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PRPF8-210ENST00000574217 PATE4P0C8F1 98 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 COX6B1P14854 86 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 PPP3CBP16298 524 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 ALOX5APP20292 161 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 PAX7P23759 505 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 ACTA2P62736 377 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 RAB1AP62820 205 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-210ENST00000574217 ACTG2P63267 376 aa5.84□□□□□ -1.47
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