RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 RAMP1O60894 148 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 CLDN9O95484 217 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 KRT6AP02538 564 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 CD48P09326 243 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 COX6A1P12074 109 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 CD1DP15813 335 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 IMPDH1P20839 514 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 BDKRB1P46663 353 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 TEX44Q53QW1 395 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 TMEM107Q6UX40 140 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 CLEC4FQ8N1N0 589 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 TMEM185BQ9H7F4 350 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 NAT14Q8WUY8 206 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 ASZ1Q8WWH4 475 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 RAD51AP1Q96B01 352 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 HAVCR1Q96D42 359 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 RCHY1Q96PM5 261 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 RNF157Q96PX1 679 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 PANX2Q96RD6 677 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 TRIB3Q96RU7 358 aa4.54□□□□□ -1.68
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