RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493977.1

OBSCN-208, Transcript of obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF, human

TSL 3

Gene OBSCN, Length 732 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OBSCN-208	ENST00000493977	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		13.6	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	NR4A2	P43354	598 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	PDLIM4	P50479	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	DAP	P51397	102 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	CLRN1	P58418	232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	SYT14	Q8NB59	555 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	RASD2	Q96D21	266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	SOX7	Q9BT81	388 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.59	□□□□□ -0.23
OBSCN-208	ENST00000493977	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	OSM	P13725	252 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	PRKACG	P22612	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	FMOD	Q06828	376 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	RBP7	Q96R05	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	PKP2	Q99959	881 aa		13.58	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977		G3V2T6	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	NDUFS8	O00217	210 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	SLC2A10	O95528	541 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	BMP4	P12644	408 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	HNF1A	P20823	631 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	CARTPT	Q16568	116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	C1orf159	Q96HA4	380 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	MOK	Q9UQ07	419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.57	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977		E9PQ18	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	XKRY	O14609	159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	SOX14	O95416	240 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	WNT11	O96014	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	B4GALT1	P15291	398 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	CTLA4	P16410	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	CDK5	Q00535	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	MYBPC1	Q00872	1141 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	CD47	Q08722	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	CR1L	Q2VPA4	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	STMN2	Q93045	179 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	USE1	Q9NZ43	259 aa		13.56	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977		A0A096LPE4	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	OR6C68	A6NDL8	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977		H7C1C5	153 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	DCTN6	O00399	190 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	SOCS2	O14508	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	TGFA	P01135	160 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	CBR1	P16152	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	NPR2	P20594	1047 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	GRK5	P34947	590 aa		13.55	□□□□□ -0.24
OBSCN-208	ENST00000493977	GIPR	P48546	466 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms