RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 NGBQ9NPG2 151 aa10.01□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa10.01□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 POLR1DQ9Y2S0 133 aa10.01□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa10.01□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 HCFC1P51610 2035 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCDC182A6NF36 153 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 TUBAL3A6NHL2 446 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM171A2A8MVW0 826 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 DENRO43583 198 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ENTPD6O75354 484 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB36O95755 333 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 TFP02787 698 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ARR3P36575 388 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 MTNR1AP48039 350 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ENTPD1P49961 510 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 CSNK2BP67870 215 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 PPA1Q15181 289 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 TSC22D1Q15714 1073 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 PCK2Q16822 640 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 GSG1Q2KHT4 349 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRT80Q6KB66 452 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM53Q6P2H8 277 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 SHFQ7M4L6 423 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 SKA3Q8IX90 412 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF454Q8N9F8 522 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 APH1BQ8WW43 257 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBE2FQ969M7 185 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 DACH2Q96NX9 599 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 C1orf198Q9H425 327 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC25A15Q9Y619 301 aa10□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 IRGMA1A4Y4 181 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 TVP23AA6NH52 213 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 PTHP01270 115 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGFBP2P18065 325 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ATP6V1E1P36543 226 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 CXCR4P61073 352 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB40BQ12829 278 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDK5R2Q13319 367 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAB1Q15750 504 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC16A9Q7RTY1 509 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 TIGD4Q8IY51 512 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 LRRC18Q8N456 261 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 WDR31Q8NA23 367 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF511Q8NB15 262 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ACBD4Q8NC06 268 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 GJC3Q8NFK1 279 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR52N5Q8NH56 324 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 MARVELD3Q96A59 401 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 SH3GL3Q99963 347 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 EMC7Q9NPA0 242 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ATPIF1Q9UII2 106 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.99□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 PHYHO14832 338 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 GOSR1O95249 250 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 MPZL1O95297 269 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 GPANK1O95872 356 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGKV3-15P01624 115 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 HLA-HP01893 362 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 SCG5P05408 212 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPARCP09486 303 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 SBK2P0C263 348 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 EPXP11678 715 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 CD79AP11912 226 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRF1P14222 555 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 CBR1P16152 277 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF32P17041 273 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 KIR2DL3P43628 341 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB1AP62820 205 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ACTC1P68032 377 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ACTA1P68133 377 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 PLP2Q04941 152 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF91Q05481 1191 aa9.98□□□□□ -0.81
ARHGEF3-211ENST00000486829 MED21Q13503 144 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms