RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 DUSP13Q9UII6 198 aa8.31□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 B9D1Q9UPM9 204 aa8.31□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.31□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 APCP25054 2843 aa8.31□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ROS1P08922 2347 aa8.31□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 CADP27708 2225 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 A0A1W2PPR1 153 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 B9A039 149 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 SGCEO43556 437 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 DOK2O60496 412 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 FAM157BP0CG42 384 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 NR4A1P22736 598 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 GCH1P30793 250 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 GRK5P34947 590 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 THBS4P35443 961 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ACTR3P61158 418 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 TEKQ02763 1124 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 AQP6Q13520 282 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 SNAPC1Q16533 368 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 PGGHGQ32M88 737 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 LNX2Q8N448 690 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 SNX33Q8WV41 574 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 TSSK2Q96PF2 358 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 PITX2Q99697 317 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 NOX3Q9HBY0 568 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 FKBP7Q9Y680 259 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.3□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 OR6C68A6NDL8 312 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 BHLHE40O14503 412 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 MPZL1O95297 269 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ABHD16AO95870 558 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 SOD3P08294 240 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 CCL2P13500 99 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 IGFBP5P24593 272 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 CALCRP30988 508 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 PYCR1P32322 319 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 GLRXP35754 106 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 CDKN1AP38936 164 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 PTH2RP49190 550 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 NUDT6P53370 316 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 UCP2P55851 309 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 FXYD6P3P58550 94 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ESRRGP62508 458 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ADAM8P78325 824 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 PSG4Q00888 419 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 CARTPTQ16568 116 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 KLHL12Q53G59 568 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ZNF774Q6NX45 483 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 OR6V1Q8N148 313 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 NUP37Q8NFH4 326 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 OR1J1Q8NGS3 322 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 COG8Q96MW5 612 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 FN3KQ9H479 309 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-208ENST00000462335 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms