RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MPP4	Q96JB8	637 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SIAE	Q9HAT2	523 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF69	Q9UC07	566 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PRG6	482 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPBD1	B2RD01	187 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NGF	P01138	241 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	MT-ND1	P03886	318 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H2AB	P04908	130 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ADH4	P08319	380 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	FUT1	P19526	365 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFRSF1B	P20333	461 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	GCH1	P30793	250 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PCGF2	P35227	344 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP4B	P51164	291 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PSG4	Q00888	419 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	MOG	Q16653	247 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	DOK3	Q7L591	496 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD4	Q8TB40	342 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NSMAF	Q92636	917 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CGREF1	Q99674	301 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NTN4	Q9HB63	628 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	INIP	Q9NRY2	104 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ICMT	O60725	284 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	OR7A10	O76100	309 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CD55	P08174	381 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN19	P0C672	248 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PRTN3	P24158	256 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	FPR2	P25090	351 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1CB	P62140	327 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CD47	Q08722	323 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXL1	Q12952	345 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SGCA	Q16586	387 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	DPP10	Q8N608	796 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ST7L	Q8TDW4	575 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	POFUT1	Q9H488	388 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NPTN	Q9Y639	398 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PIP5K1C	O60331	668 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXH1	O75593	365 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHM	P01871	453 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF12	P17014	697 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	LAP3	P28838	519 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	GZMM	P51124	257 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC3A1	Q07837	685 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF154	Q13106	437 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM27B	Q5VT28	67 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF774	Q6NX45	483 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10A6	Q8NH74	314 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SGTB	Q96EQ0	304 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP50	Q9UKX7	468 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MXK9	166 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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