RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP3M1Q9Y2T2 418 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAKP20794 623 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCH1P30793 250 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT5AP41221 380 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YAP1P46937 504 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTXN1P60606 82 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSG4Q00888 419 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MVKQ03426 396 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF718Q3SXZ3 478 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM205BPQ63HN1 556 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGFN1Q86VF2 1251 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF101Q8IZC7 436 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHCGQ9UBD6 479 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC100509620A0A075B734 347 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A2O15244 555 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNW1P05000 195 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGA2P17301 1181 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAP3P28838 519 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF81P51508 661 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAM2Q15035 370 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSTQ16762 297 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA46Q5T0L3 261 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AVPI1Q5T686 147 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP51Q70EK9 711 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARPINQ7Z6K5 226 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VTCN1Q7Z7D3 282 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRMQ8IXM6 262 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN22Q8N7P3 220 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51A7Q8NH64 312 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CMTM6Q9NX76 183 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMCX1Q9P291 453 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV27A0A087WT01 109 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV20A0A0B4J274 112 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A6NIZ1 184 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CST2P09228 141 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FUT4P22083 530 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAP1BP61224 184 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAP1AP62834 184 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKDD1AQ495B1 522 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OAFQ86UD1 273 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POU5F2Q8N7G0 328 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC75AQ8NAA5 344 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2H1Q9GZK4 316 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT5BQ9H1J7 359 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OCEL1Q9H607 264 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF665Q9H7R5 613 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAP30LQ9HAJ7 183 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLSCR5A0PG75 271 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB9A8MZ26 197 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN25C9JDP6 229 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 J3KTA2 159 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAX1O00165 279 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANPEPP15144 967 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPV17P39210 176 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCBD1P61457 104 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKCDQ05655 676 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HFEQ30201 348 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf174Q8IYL3 243 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A40Q8TBP6 338 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PPL8 197 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF682O95780 498 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIPEQ05469 1076 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCGB2A2Q13296 93 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM209AQ5JX71 171 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSM5Q6NUN0 579 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD4Q8TB40 342 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB39BQ96DA2 213 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELMOD3Q96FG2 381 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAHD2AQ96GK7 314 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2J1Q9GZK6 312 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNG2Q9Y698 323 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXCR6O00574 342 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FFAR1O14842 300 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTA4O15217 222 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRY3O43610 288 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV1-46P01743 117 aa22.27■■□□□ 1.16
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