RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5M10Q6IEU7 315 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF621Q6ZSS3 439 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 SYS1Q8N2H4 156 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 PRELID2Q8N945 189 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 SMARCD2Q92925 531 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35B4Q969S0 331 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ACTR6Q9GZN1 396 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKHQ9HCJ1 492 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 STMN3Q9NZ72 180 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 PRELID1Q9Y255 219 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 SZT2Q5T011 3432 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 PEAK1Q9H792 1746 aa3.73□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN11A1L157 253 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 EFCAB7A8K855 629 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 GJB5O95377 273 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 HBE1P02100 147 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV1-2P23083 117 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 HTR2CP28335 458 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 OR1E1P30953 314 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP12AP54707 1039 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP6V0D1P61421 351 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 CSNK1G2P78368 415 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ECH1Q13011 328 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMD5Q16401 504 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 GABRA6Q16445 453 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 UTF1Q5T230 341 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 TMUB2Q71RG4 321 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR22Q8IZ63 422 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 C4orf32Q8N8J7 132 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ITFG1Q8TB96 612 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 MRIQ9BWK5 157 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 SIAEQ9HAT2 523 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 FGF22Q9HCT0 170 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ING4Q9UNL4 249 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 COL24A1Q17RW2 1714 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 FYCO1Q9BQS8 1478 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0C4DFX4 3053 aa3.72□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBED9Q6R2W3 1325 aa3.71□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.81
CBX1P4-201ENST00000439415 TNS3Q68CZ2 1445 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A087X002 238 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GW15 77 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PQ72 361 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 DHRS7CA6NNS2 312 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 LYRM9A8MSI8 78 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 PLPP1O14494 284 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 IDH3BO43837 385 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 LSM8O95777 96 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 RPN2P04844 631 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 LAMP1P11279 417 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKAR2BP31323 418 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 HMGCLP35914 325 aa3.71□□□□□ -1.82
CBX1P4-201ENST00000439415 RFC3P40938 356 aa3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms