RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 A1BGP04217 495 aa23.87■■□□□ 1.41
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PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 IDEP14735 1019 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRJ-208ENST00000615445 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.86■■□□□ 1.41
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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PTPRJ-208ENST00000615445 TSPY8P0CW00 308 aa23.86■■□□□ 1.41
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PTPRJ-208ENST00000615445 NYXQ9GZU5 481 aa23.86■■□□□ 1.41
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PTPRJ-208ENST00000615445 NEMFO60524 1076 aa23.78■■□□□ 1.4
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PTPRJ-208ENST00000615445 PICALMQ13492 652 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRJ-208ENST00000615445 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRJ-208ENST00000615445 GNPATO15228 680 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRJ-208ENST00000615445 IQCEQ6IPM2 695 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF5CO60282 957 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.77■■□□□ 1.4
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