RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558776.1

MED28P6-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene MED28P6, Length 231 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P6-201ENST00000558776 SLC27A3Q5K4L6 730 aa4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 BICDL1Q6ZP65 573 aa4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 APPBP2Q92624 585 aa4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 EHD4Q9H223 541 aa4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 USP20Q9Y2K6 914 aa4.76□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 F6X3S4 739 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 EREGO14944 169 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 CES1P23141 567 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 INPP5BP32019 993 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 RELBQ01201 579 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 RASA3Q14644 834 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 TNNI3KQ59H18 835 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 HSH2DQ96JZ2 352 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PSMD1Q99460 953 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 FANCLQ9NW38 375 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PPM1HQ9ULR3 514 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.75□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 GPC1P35052 558 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 FCGRTP55899 365 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 NNTQ13423 1086 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 MAP3K11Q16584 847 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 C4orf17Q53FE4 359 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ARSHQ5FYA8 562 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 Q6ZVU0 165 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 SV2BQ7L1I2 683 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 BTLAQ7Z6A9 289 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 HOMER1Q86YM7 354 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 C7orf43Q8WVR3 580 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 AGBL1Q96MI9 1066 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 CHRDQ9H2X0 955 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 WASF2Q9Y6W5 498 aa4.74□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 WNT7AO00755 349 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 XYLBO75191 536 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 EDN3P14138 238 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 APOBRQ0VD83 1088 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 TRPM4Q8TD43 1214 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ANKRD24Q8TF21 1146 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 NKD1Q969G9 470 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 CNTN3Q9P232 1028 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.73□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 A0A1W2PP55 124 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PLEKHD1A6NEE1 506 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 ALDH1A1P00352 501 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 S100BP04271 92 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PHKA2P46019 1235 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 LIG3P49916 1009 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 NLRP13Q86W25 1043 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 PHC3Q8NDX5 983 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 GLIS3Q8NEA6 775 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 CRBNQ96SW2 442 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 DNAJC7Q99615 494 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 CEP44Q9C0F1 390 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 UBP1Q9NZI7 540 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 CHPF2Q9P2E5 772 aa4.72□□□□□ -1.65
MED28P6-201ENST00000558776 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.71□□□□□ -1.66
MED28P6-201ENST00000558776 ESYT3A0FGR9 886 aa4.71□□□□□ -1.66
MED28P6-201ENST00000558776 WIPF1O43516 503 aa4.71□□□□□ -1.66
MED28P6-201ENST00000558776 GREM1O60565 184 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms